西尼罗病毒诱导衰老基因Lgals3bp表达调控大脑皮层小胶质细胞表型

该数据集来自NCBI GEO,聚焦西尼罗病毒感染后小胶质细胞衰老相关基因表达变化,特别是Lgals3bp在神经炎症和小胶质细胞表型调控中的作用

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基因组分类GPL2424710090
GSE270687: West Nile Virus-induced expression of senescent gene Lgals3bpregulates microglial phenotype within cerebral cortex

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-29

资源简介

西尼罗病毒诱导衰老基因Lgals3bp表达调控大脑皮层小胶质细胞表型

West Nile Virus-induced expression of senescent gene Lgals3bpregulates microglial phenotype within cerebral cortex

该数据集来自NCBI GEO,聚焦西尼罗病毒感染后小胶质细胞衰老相关基因表达变化,特别是Lgals3bp在神经炎症和小胶质细胞表型调控中的作用。研究结合空间转录组学、RNA测序和流式细胞术,分析成年与老年小鼠从西尼罗病毒脑炎恢复后小胶质细胞基因特征的变化,并利用Lgals3bp缺陷小鼠评估其对神经炎症的影响。数据包含1个文件,可用于研究病毒感染与脑衰老的转录组关联及小胶质细胞表型分类(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 25 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):小胶质细胞是中枢神经系统的常驻巨噬细胞,在多种神经系统疾病条件下表现出基因表达改变。本研究探讨西尼罗病毒感染与小胶质细胞衰老之间的关系,重点关注LGALS3BP的作用,该蛋白同时参与抗病毒反应和衰老过程。利用空间转录组学、RNA测序和流式细胞术,我们表征了成年和老年小鼠从西尼罗病毒脑炎恢复后小胶质细胞基因特征的变化。此外,我们分析了Lgals3bp的表达,并构建了Lgals3bp缺陷小鼠以评估其对神经炎症和小胶质细胞表型的影响。我们的结果表明,西尼罗病毒激活的小胶质细胞与衰老小胶质细胞共享转录特征,包括干扰素反应和炎症相关基因的上调。Lgals3bp在t

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE270687

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 16 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

小胶质细胞是中枢神经系统的常驻巨噬细胞,在多种神经系统疾病状态下表现出基因表达的改变。本研究探讨西尼罗病毒感染与小胶质细胞衰老之间的关系,重点关注LGALS3BP的作用,该蛋白同时参与抗病毒反应和衰老过程。我们采用空间转录组学、RNA测序和流式细胞术,表征了成年和老年小鼠在从WNV脑炎恢复后小胶质细胞基因特征的变化。此外,我们分析了Lgals3bp的表达,并构建了Lgals3bp缺陷小鼠,以评估其对神经炎症和小胶质细胞表型的影响。我们的结果表明,WNV激活的小胶质细胞与衰老小胶质细胞具有共同的转录特征,包括干扰素反应和炎症相关基因的上调。Lgals3bp在中枢神经系统中广泛表达,并在WNV感染和衰老过程中显著上调。Lgals3bp缺陷小鼠表现出神经炎症减轻、稳态小胶质细胞数量增加以及T细胞群体改变,而病毒学控制或生存率无差异。

该数据表明,LGALS3BP在调节神经炎症和小胶质细胞激活中发挥作用,并提示靶向LGALS3BP可能为减轻衰老及病毒感染后神经炎症相关认知衰退提供潜在途径。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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