中枢神经系统血管床体内内皮细胞翻译组比较分析（EC sorted）

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数据说明

内皮细胞（ECs）表现出器官和组织特异性异质性。在眼中，视网膜和脉络膜血管床是不同的网络，具有不同的形态和功能特征，前者代表紧密屏障，后者则为可渗透的有孔血管系统。鉴于视网膜健康关键依赖于这些血管床的功能，且其功能障碍与多种视网膜疾病相关，因此从分子层面理解这些不同血管系统的生理和病理生理特征至关重要。由于其在实质细胞中交错分布的解剖学特点，体内研究EC基因表达一直受到难以分离足够数量纯眼部EC群体以进行大规模转录组学的挑战所阻碍。

为应对这一挑战，我们提出了一种方法学与分析工作流程，以促进利用Cre诱导型NuTRAP flox构建体以及两种广泛使用的内皮cre小鼠品系（组成型Tie2-Cre和他莫昔芬诱导型Cdh5-CreERT2）从脉络膜、视网膜和脑中分离的体内内皮细胞翻译组进行组织间比较，这两种品系表达EGFP和mCherry标签，用于细胞特异性分离细胞核和核糖体。在每个模型中，TRAP-RNAseq富集（TRAP翻译组与输入转录组）的组织间比较显示，组织特异性基因富集具有差异性的通路代表性。对于每个小鼠模型，内皮细胞翻译组的组织间比较（脉络膜与脑、脉络膜与视网膜、脑与视网膜）显示，在三组配对比较之间，差异表达基因（DEGs）的重叠超过50%，且每个组织具有差异性的通路代表性。在视网膜、脉络膜和脑中，Cdh5-NT与Tie2-NT比较中DEGs的通路分析预测髓系细胞功能和活化相关过程受到抑制，这与Cdh5-NT相比t

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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