损伤成年CNS中增强fibronectin水平促进轴突再生[scRNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE269812

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为了修复受损的中枢神经系统（CNS）神经/传导束，免疫细胞被招募到损伤部位，但成年哺乳动物的内源性反应不足以促进断裂轴突的再生。在此，我们发现，视神经夹伤（ONC）损伤后存活的一部分视网膜神经节细胞（RGC）中枢神经系统投射神经元中，富含并上调与纤连蛋白（Fn）相互作用的整合素Itga5和ItgaV，并且Fn在培养中促进一部分轴突切断的成年RGC的长期存活和长距离轴突再生。我们随后表明，Fn在视神经和脊髓的轴突束中随发育而下调，但损伤激活的巨噬细胞/小胶质细胞上调Fn，而促进轴突再生的zymosan增强其募集（从而增加损伤视神经中的Fn水平）。最后，我们发现，已知与Itga5和ItgaV相互作用的Fn的RGD基序，在体内ONC后促进成年RGC的长期存活和长距离轴突再生，当与Rpl7a基因治疗联合处理时，部分轴突可到达视交叉。

因此，在受损的中枢神经系统中实验性地增加Fn水平，是一种有前景的治疗策略，至少能对部分神经元实现神经保护和轴突再生。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。