GSE268182：TMEFF1是单纯疱疹病毒的神经元特异性限制因子

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE268182

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数据说明

大脑对感染和炎症造成的损伤高度敏感。单纯疱疹病毒1型（HSV-1）是一种嗜神经病毒，也是单纯疱疹脑炎的病因。目前尚不清楚神经元特异性抗病毒因子是否通过控制病毒复制来防止感染和过度炎症反应，从而保护大脑。通过对HSV-1限制因子进行全基因组CRISPR筛选，我们鉴定出TMEFF1——它特异性表达于中枢神经系统神经元中，且不受I型干扰素调控——是已知控制病毒感染的最佳先天抗病毒系统。在干细胞来源的人神经元中敲低TMEFF1会导致HSV-1感染后病毒复制升高和神经元死亡。TMEFF1通过与Nectin-1和非肌型肌球蛋白重链IIA/B相互作用，在病毒进入阶段阻断HSV-1复制周期；这两个蛋白分别是病毒-细胞结合和病毒-细胞融合的核心蛋白。重要的是，Tmeff1-/-小鼠表现出对脑内HSV-1感染的易感性增加，而外周组织则不然。在脑内，病毒载量升高特异性地见于神经元。

我们的研究确认TMEFF1是一种神经元特异性限制因子，对于防止HSV-1在中枢神经系统中的复制至关重要。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。