伤害感受器-免疫相互作用组揭示疼痛的损伤特异性免疫特征

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE255686

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

与组织损伤和感染相关的炎性疼痛，主要源于伤害性感受器感觉神经元外周末梢在暴露于炎症介质后敏感性增高。靶向免疫来源的炎症配体（如前列腺素E2）可减轻炎性疼痛，但仍需要更有效、更安全的疗法。然而，免疫细胞和感觉神经元类型、其配体及受体的多样性，使得阐明参与炎性疼痛的免疫机制颇具挑战。因此，我们采用单细胞转录组学，探讨在不同炎性疼痛模型中哪些特定免疫细胞类型影响疼痛的发生发展。我们发现，巨噬细胞和中性粒细胞募集的程度，以及Cx3cr1高表达和MHCII+真皮巨噬细胞中损伤触发的转录程序，均与炎性痛觉过敏的动力学高度一致。我们构建了一份涵盖受体、配体和代谢物的潜在细胞-细胞相互作用综合清单，并基于免疫细胞和感觉神经元单细胞转录组数据，生成了损伤特异性的神经免疫相互作用组。

该分析揭示了多种炎性疼痛模型共有的相互作用以及特定病症特有的相互作用，并发现了此前未被认定为疼痛调节因子的免疫介质。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。