Nfe2l3 促进体内损伤后神经保护与长距离轴突再生 [第三方：scRNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE253839

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

核因子E2相关因子（Nfe2l）基因家族成员1-3介导细胞对氧化应激的反应，包括在中枢神经系统（CNS）中。然而，Nfe2l3的神经元功能尚不清楚。在此，我们比较评估了Nfe2l1、Nfe2l2和Nfe2l3在单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析的大脑皮层和视网膜神经节细胞（RGC）CNS投射神经元中的表达，研究了Nfe2l3是否在体内调节CNS损伤后的神经保护和轴突再生，并表征了神经元中与Nfe2l3相关的基因网络。我们发现，Nfe2l3的表达在发育中的未成熟皮层和RGC投射神经元中短暂达到峰值，但在成年神经元中几乎消失，且损伤后不上调。此外，在视网膜内，Nfe2l3富集于RGCs，而Nfe2l1和Nfe2l2在其他视网膜细胞类型中也大量表达，并在损伤后上调。我们还发现，通过局部眼内病毒载体递送在受损RGCs中表达Nfe2l3，可促进体内视神经损伤后的神经保护和长距离轴突再生。

此外，Nfe2l3治疗提供了与靶向Pten和Klf9的病毒载体相似的神经保护和轴突再生程度，Pten和Klf9是神经保护和长距离轴突再生的著名调节因子。最后，我们通过生物信息学方法表征了神经元中与Nfe2l3相关的基因网络，揭示了Nfe2l3与已确立的神经保护和轴突再生机制的关联。因此，Nfe2l3是一种新型的神经保护和促进轴突再生的因子，具有治疗中枢神经系统损伤和疾病的治疗潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。