小鼠肠神经系统发育中富集miRNA测序数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE250527

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肠神经系统（ENS）是肠壁中由神经元和胶质细胞组成的重要网络。ENS发育缺陷可导致先天性巨结肠症（HSCR），这是一种危及生命的疾病，以严重便秘、腹胀、胆汁性呕吐和生长发育迟缓为特征。越来越多的文献将HSCR与miRNA表达改变联系起来，但关于发育中ENS正常miRNA图谱的数据有限。我们对妊娠中期的Ednrb-EGFP小鼠ENS前体细胞进行了小RNA测序（smRNA-seq）和信使RNA测序（mRNA-seq），并将结果与发育中肠道所有其他细胞的聚合RNA进行了比较。我们的smRNA-seq结果鉴定出73个在发育中ENS中显著富集且高表达的miRNA，其中miR-9、miR-27b、miR-124、miR-137和miR-488是我们在人类中保守的前5个miRNA。然而，与先前报道相反，我们对miR-137的后续分析显示，在Nestin-cre、Wnt1-cre、Sox10-cre或Baf53b-cre谱系细胞中缺失Mir137对小鼠存活或ENS发育没有影响。

我们的数据为未来HSCR及其他ENS疾病中miRNA的研究提供了重要背景，并凸显了关于发育过程中特定设施因素的未解问题。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。