小鼠ES细胞来源内胚层中诱导过表达Pdx1和Ngn3诱导胰腺分化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE23752

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在激活素诱导的内胚层群体中诱导Pdx1过表达，导致第20天胰腺相关基因如胰岛素1和2的上调。为促进从胰腺芽到内分泌谱系形成的发育进程，我们接下来将neurogenin3（Ngn3）与Pdx-1共同表达。诱导Pdx1与Ngn3共同过表达，在分化第9天显著增加了胰岛素1 mRNA。诱导的EBs中胰岛素1 mRNA水平约为胰岛素瘤细胞系betaTC6中所见的100%。我们还通过免疫组织化学确认了胰岛素和C肽染色。这些细胞加工并分泌胰岛素，并对各种胰岛素促分泌剂作出反应。这些诱导效应仅限于c-kit+内胚层富集的EB衍生群体，表明在该模型中Pdx1/Ngn3在内胚层胰腺特化水平上发挥作用。微阵列分析显示，Pdx1/Ngn3调控广谱胰腺内分泌细胞相关基因的表达。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。