人类遗传性RIPK3缺陷中脑炎及神经元死亡介导的单纯疱疹病毒控制不良
该数据集来自NCBI GEO(GSE228495),包含1个文件,为高通量RNA测序表达谱数据。研究对健康对照、RIPK3 HSE患者及TLR3、IFNAR1或NEMO隐性缺陷患者的人原代成纤维细胞,在无或HSV-1感染24小时条件下进行bulk RNA测序,以在转录组水平检测细胞对HSV-1的应答

基本信息
资源简介
人类遗传性RIPK3缺陷中脑炎及神经元死亡介导的单纯疱疹病毒控制不良
Encephalitis and poor neuronal death-mediated control of herpes simplex virus in human inherited RIPK3 deficiency
该数据集来自NCBI GEO(GSE228495),包含1个文件,为高通量RNA测序表达谱数据。研究对健康对照、RIPK3 HSE患者及TLR3、IFNAR1或NEMO隐性缺陷患者的人原代成纤维细胞,在无或HSV-1感染24小时条件下进行bulk RNA测序,以在转录组水平检测细胞对HSV-1的应答。数据可用于分析RIPK3缺陷对I型IFN介导抗病毒免疫的影响,并比较不同遗传缺陷患者的转录组差异(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 29 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们假设人类RIPK3缺陷不会导致I型IFN介导的抗病毒免疫受损,这与TLR3-IFNAR1通路缺陷中的情况形成对比。为了在宽转录组水平检测对HSV1的细胞应答,我们对来自健康对照、RIPK3 HSE患者以及其他隐性TLR3、IFNAR1或NEMO缺陷患者的人原代成纤维细胞,在无或HSV-1感染24小时的条件下进行了bulk RNA测序。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE228495
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 28 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们假设人类RIPK3缺陷不会导致I型干扰素介导的抗病毒免疫受损,这与TLR3-IFNAR1通路缺陷的情况形成对比。为了在广泛转录组水平上测试细胞对HSV1的反应,我们对来自健康对照、RIPK3 HSE患者以及其他隐性TLR3、IFNAR1或NEMO缺陷患者的原代人成纤维细胞进行了批量RNA测序,这些细胞在有无HSV-1感染的情况下培养24小时。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




