GSE228486：发育下调的Crmp1、Crmp4和Crmp5促进视神经损伤后轴突再生和视网膜神经节细胞存活的实验基因表达[第三方再分析]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE228486

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数据说明

塌陷反应介导蛋白（Crmps）在神经元发育和轴突生长中发挥作用。然而，Crmp1、Crmp4和Crmp5在体内受损中枢神经系统（CNS）轴突再生中的神经元特异性作用尚不清楚。在此，我们分析了视网膜神经节细胞（RGCs）中Crmp基因的发育性和亚型特异性表达，测试了通过局部眼内AAV2递送在RGCs中过表达Crmp1、Crmp4或Crmp5是否促进体内视神经损伤后的轴突再生，并表征了与Crmps相关的基因概念网络的发育性共调控。我们发现，所有Crmp基因在RGCs成熟过程中均发育性下调。然而，虽然Crmp1、Crmp2和Crmp4在大多数RGC亚型中以不同程度表达，但Crmp3和Crmp5仅在一小部分RGC亚型中表达。随后我们发现，视神经损伤后，Crmp1、Crmp4和Crmp5在不同程度上促进RGC轴突再生，其中Crmp4促进的轴突再生最多，并且还定位于轴突。我们还发现，Crmp1和Crmp4（而非Crmp5）促进RGC存活。

最后，我们发现Crmp1、Crmp2、Crmp4和Crmp5促进轴突再生的能力与调控RGC内在轴突生长能力的神经发育机制相关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。