自噬受体SHISA9调控脑胶质细胞抗病毒免疫异质性与CNS炎症

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE216271

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数据说明

脑胶质细胞具有高度异质性，可改变其基因图谱和反应敏感性，从而对环境变化作出适当反应，维持中枢神经系统稳态。然而，技术限制阻碍了对中枢神经系统驻留免疫细胞自我调控活动的研究。小胶质细胞和星形胶质细胞是中枢神经系统病毒感染早期的主要反应细胞。它们的激活不仅有助于招募外周免疫细胞以协助病毒清除，还增加了与多种神经退行性疾病相关的长期有害炎症损伤的风险。最佳的自噬活性对维持脑完整性至关重要，但脑胶质细胞中免疫活动的自噬调控仍知之甚少。在此，我们鉴定膜蛋白SHISA9作为一种自噬货物受体，可调节中枢神经系统感染期间的异质性免疫反应。通过10x单细胞RNA测序，我们鉴定出Shisa9表达增加、随后炎症转录程序表达降低的星形胶质细胞。

Shisa9在感染不同阶段对小胶质细胞和星形胶质细胞的抗病毒及炎症反应均具有时间性调控特征。Shisa9-/-小鼠对单纯疱疹病毒脑炎高度易感，伴有更高比例的致病性星形胶质细胞，这可能促进神经退行性病变进展，且与野生型小鼠相比表现出更严重的神经炎症症状。综上所述，我们的研究揭示了选择性自噬通过SHISA9-IKKi轴协调不同中枢神经系统驻留细胞免疫异质性的关键作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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