内皮特异性Crif1缺陷小鼠脑微血管转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE207106

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑血管中的内皮细胞（ECs）被认为是急性出血性脑损伤的主要靶点。内皮细胞功能障碍可通过引发继发性炎症反应和血脑屏障（BBB）破坏而加重神经元损伤。已知构成血脑屏障的内皮细胞与外周内皮细胞相比具有更高的线粒体体积。在先前的研究中，我们报道了Tek-CRIF1敲除（KO）小鼠，其内皮细胞特异性缺失线粒体氧化磷酸化相关基因Crif1（又称Gadd45gip1，编码GADD45G相互作用蛋白1），表现出严重的血脑屏障缺陷，并伴有内皮细胞中连接蛋白表达降低。为鉴定连接内皮细胞特异性线粒体功能障碍与血脑屏障破坏的信号通路，我们首先使用从Tek-CRIF1小鼠分离的脑血管进行了RNA测序。对Tek-CRIF1-KO小鼠的这一转录组分析揭示了一些信号通路的显著变化，该通路与血脑屏障的维持密切相关。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。