母体胆固醇暴露模型:人脑类器官神经祖细胞增殖减少

该数据集来自 NCBI GEO(GSE206587),利用 hiPSC 来源的人脑类器官构建外源性胆固醇暴露模型,并通过单细胞 RNA 测序分析额外胆固醇暴露下脑类器官的基因表达变化

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基因组回归GPL246769606
GSE206587: Modeling maternal cholesterol exposure reveals a reduction of neural progenitor proliferation using human cerebral organoids

基本信息

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创建/更新时间
2026-11-02

资源简介

母体胆固醇暴露模型:人脑类器官神经祖细胞增殖减少

Modeling maternal cholesterol exposure reveals a reduction of neural progenitor proliferation using human cerebral organoids

该数据集来自 NCBI GEO(GSE206587),利用 hiPSC 来源的人脑类器官构建外源性胆固醇暴露模型,并通过单细胞 RNA 测序分析额外胆固醇暴露下脑类器官的基因表达变化。数据包含 1 个文件(GSE206587_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱分析,物种为人(9606),平台为 GPL24676。可用于研究母体高胆固醇暴露与子代神经发育障碍风险之间的关联及潜在机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 21 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):母体肥胖会增加子代高胆固醇暴露的风险。队列和动物模型研究报告,母体肥胖可能增加子代神经发育障碍(NDDs)的风险,包括智力障碍和自闭症谱系障碍(ASD)。然而,高胆固醇暴露是否导致大脑发育缺陷及其潜在机制仍不清楚。在此,我们通过向培养体系中外源性添加胆固醇,利用 hiPSC 来源的脑类器官构建了胆固醇暴露模型。我们进行了 scRNA 测序分析,以探究额外胆固醇暴露下脑类器官的基因表达变化。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE206587

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 20 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

母亲肥胖会增加其后代暴露于高胆固醇的风险。队列研究和动物模型研究表明,母亲肥胖可能增加后代患神经发育障碍(NDDs)的风险,包括智力障碍和自闭症谱系障碍(ASD)。然而,高胆固醇暴露是否导致大脑发育缺陷及其潜在机制仍不清楚。在此,我们通过在外源性向培养系统中添加胆固醇,利用hiPSC来源的脑类器官构建了胆固醇暴露模型。我们进行了scRNA测序分析,以探究额外胆固醇暴露下脑类器官中的基因表达变化。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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