THAP1是人及大鼠肌张力障碍综合征关键SP1家族细胞类型依赖性调控因子[SH-SY5Y ChIP-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE184957

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

THAP1是一种转录因子，其突变是DYT6肌张力障碍的致病原因。然而，THAP1突变如何导致这些基因表达改变，以及这些基因表达变化是否也反映在THAP1患者的大脑中，目前仍不清楚。本研究采用表观遗传学和转录组学方法，结合多种模型系统，以揭示THAP1的功能及DYT6肌张力障碍的潜在发病机制。THAP1突变主要通过以细胞类型依赖的方式调控SP1家族成员SP1和SP4，从而导致基因失调。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。