小鼠每日睡眠需求转录调控的分子通路

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE182805

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

不同哺乳动物的每日睡眠配额差异很大，长颈鹿为2-4小时，而考拉和蝙蝠则达20-22小时。在人类中，个体的睡眠数量和质量受遗传因素调控，并呈现年龄依赖性变化。然而，调控哺乳动物每日睡眠需求的分子通路和效应机制仍不清楚。本研究利用成年脑嵌合（ABC）表达/敲除（KO）系统对成年小鼠睡眠进行体细胞遗传学分析，发现组蛋白去乙酰化酶HDAC4/5的功能获得可显著减少每日非快速眼动睡眠（NREMS）量和δ功率——这两个睡眠需求的关键指标，而HDAC4/5的功能缺失则增加NREMS量和δ功率。类似地，ABC表达cAMP反应元件结合蛋白（CREB）或A-CREB（CREB转录活性抑制剂）分别降低或增加NREMS量和δ功率。遗传学和转录组学联合分析揭示，HDAC4在转录调控和睡眠调控中均与CREB协同发挥作用。

与LKB1-SIK3激酶级联下游功能一致，HDAC4/5CA或CREB的ABC表达可挽救Sik3E13∆/+小鼠的嗜睡，而SIK3/SLP-ST221E或HDAC(4+5)VP16的ABC表达可挽救ABC-Lkb1KO小鼠的失眠。综上所述，这些结果确定了LKB1-SIK3-HDAC4/5-CREB是哺乳动物日常睡眠需求转录调控的首个主要分子通路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。