GSE171099：亨廷顿病中单神经元Patch-seq研究受损的抑制性GABA能突触传递与转录

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE171099

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

亨廷顿病（HD）中的转录失调导致纹状体神经元功能缺陷。在此，我们在体外HD模型中进行了Patch-seq，以研究突变型亨廷顿蛋白（Htt）对单个纹状体神经元突触传递和基因转录的影响。我们发现，突变型Htt的表达以细胞自主方式降低了纹状体神经元的突触输出，并鉴定出若干基因，其失调与突变型Htt神经元的生理缺陷相关。为支持表观遗传机制在HD病理生理学中的关键作用，我们发现抑制组蛋白去乙酰化酶1/3活性可纠正若干功能和形态缺陷，并减轻突变型Htt神经元中异常的转录谱。通过本研究，我们证明Patch-seq技术既可用于在单细胞水平更好地理解复杂神经系统疾病的分子机制，也可为筛选该疾病的治疗方法提供平台。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。