GSE167630：亨廷顿病循环非编码RNA

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE167630

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们通过微阵列技术，对9名早期亨廷顿病（CH）患者和13名对照者的血浆全非编码RNA表达谱进行了研究：对照组包括8名健康受试者（HD）和5名精神分裂症患者（SC）。CH患者正在接受抗精神病药物治疗，这也是SC患者最有效的治疗选择（我们将SC对照组纳入研究，以尽量减少神经阻滞剂对非编码RNA表达的影响，并识别出HD特异性的非编码RNA集）。血液样本通过静脉穿刺采集于EDTA管中，用于制备血浆。采用分步离心方案制备无细胞和血小板的血浆：样品在4°C下以1,500 g离心15分钟，上清液储存于−80°C。按照制造商说明，使用血浆/血清循环RNA纯化试剂盒（NORGEN）提取RNA。根据制造商说明，使用GeneChip miRNA 2.0阵列（Affymetrix）分析每个样本的标记RNA。原始数据使用Partek Genomic Suite软件进行分析。

在寻找差异表达的非编码RNA时，我们发现了一个与两个对照组（HD和SC）相比具有HC特异性的候选集合（p<0.05且│倍数变化│>1.5）：已证实hsa-miR-98下调，而hsa-miR-323b-3p上调；2个新的snoRNA上调。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。