突变亨廷顿蛋白停滞核糖体并抑制蛋白合成(mRNA-Seq)
研究聚焦突变亨廷顿蛋白(mHtt)在亨廷顿病细胞模型中促进核糖体停滞、抑制蛋白合成的机制,结合 Ribo-Seq 与 mRNA-Seq 揭示核糖体占据向 5' 和 3' 端偏移及特定 mRNA 上的单密码子停顿

基本信息
资源简介
突变亨廷顿蛋白停滞核糖体并抑制蛋白合成(mRNA-Seq)
Mutant huntingtin stalls ribosomes and represses protein synthesis in a cellular model of Huntington disease (mRNA-Seq)
该数据集来自 NCBI GEO(GSE166695),包含 1 个 mRNA-Seq 表达谱文件,对应 GPL19057 平台、物种 10090。研究聚焦突变亨廷顿蛋白(mHtt)在亨廷顿病细胞模型中促进核糖体停滞、抑制蛋白合成的机制,结合 Ribo-Seq 与 mRNA-Seq 揭示核糖体占据向 5' 和 3' 端偏移及特定 mRNA 上的单密码子停顿。数据可用于分析 HD 细胞中翻译调控异常、筛选核糖体停滞相关靶点,为亨廷顿病治疗机制研究提供转录组层面的支持(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 12 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):亨廷顿蛋白(mHtt)的多聚谷氨酰胺扩增导致亨廷顿病(HD)和神经退行性变,但其机制尚不清楚。本研究发现 mHtt 促进核糖体停滞并抑制蛋白合成。敲低 mHtt 可增强蛋白合成并提高核糖体易位速度,而 mHtt 在体外直接抑制蛋白合成。我们发现核糖体蛋白及翻译中的核糖体与 mHtt 存在相互作用。高分辨率全局核糖体足迹图谱(Ribo-Seq)和 mRNA-Seq 显示,与对照相比,HD 细胞中核糖体占据广泛向 5' 和 3' 端偏移,并在选定的 mRNA 靶标上出现独特的单密码子停顿。因此,mHtt 通过促进核糖体停滞阻碍翻译过程中的核糖体易位,这是一种可用于 HD 治疗开发的新机制缺陷。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL19057、10090。本站分类:神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE166695
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 06 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
亨廷顿蛋白的多聚谷氨酰胺扩增(mHtt)会导致亨廷顿病(HD)和神经退行性变,但其机制尚不清楚。本研究发现,mHtt促进核糖体停滞并抑制蛋白质合成。敲低mHtt可增强蛋白质合成并提高核糖体易位速度,而mHtt在体外直接抑制蛋白质合成。我们发现核糖体蛋白及翻译中的核糖体与mHtt存在相互作用。高分辨率全局核糖体足迹图谱分析(Ribo-Seq)和mRNA-Seq表明,与对照组相比,HD细胞中核糖体占据向5’端和3’端广泛偏移,并在选定的mRNA靶标上出现独特的单密码子停顿。因此,mHtt通过促进核糖体停滞阻碍翻译过程中的核糖体易位,这是一种新的机制性缺陷,可用于HD治疗开发。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




