急性阿片中毒后脑DNA甲基化的表观基因组研究

该数据集来自NCBI,包含背外侧前额叶皮层组织的Illumina HumanMethylationEPIC芯片数据,样本来自153例已故个体,其中72例死于急性阿片中毒、53例精神科对照、28例正常对照

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基因组分类GPL211459606
GSE164822: Epigenome-wide study of brain DNA methylation following acute opioid intoxication

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

急性阿片中毒后脑DNA甲基化的表观基因组研究

Epigenome-wide study of brain DNA methylation following acute opioid intoxication

该数据集来自NCBI,包含背外侧前额叶皮层组织的Illumina HumanMethylationEPIC芯片数据,样本来自153例已故个体,其中72例死于急性阿片中毒、53例精神科对照、28例正常对照。研究者利用这些数据开展表观基因组关联研究,发现一个位于NTN1基因内的CpG位点可能与阿片使用相关,并检测到阿片样本相比对照样本存在PhenoAge加速。数据可用于探索阿片滥用相关的脑组织DNA甲基化改变及表观遗传年龄加速(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 14 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):阿片滥用对美国个体构成重大风险,而表观遗传变化是阿片滥用的一种主要潜在生物标志物。然而,目前的证据大多局限于全血中的候选基因分析。在此,我们提供了在153例已故个体背外侧前额叶皮层组织中生成的Illumina HumanMethylationEPIC阵列数据:其中72例死于急性阿片中毒,53例精神科对照,28例正常对照。利用这些数据,我们进行了表观基因组关联研究,并鉴定出一个位于基因(NTN1)内、可能与阿片使用相关的CpG位点。我们还检测到,与对照样本相比,阿片样本中PhenoAge加速。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21145、9606。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE164822

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 01 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿片类药物滥用对美国个体构成重大风险,而表观遗传学改变是阿片类药物滥用的主要潜在生物标志物。然而,目前的证据大多局限于全血中的候选基因分析。在此,我们提供了来自153名已故个体的背外侧前额叶皮层组织中所生成的Illumina HumanMethylationEPIC阵列数据:其中72人死于急性阿片类药物中毒,53人为精神科对照,28人为正常对照。利用这些数据,我们进行了全表观基因组关联研究,并鉴定出一个可能与非阿片类药物使用相关的基因(NTN1)内的一个CpG位点。我们还检测到,与对照样本相比,阿片类药物样本中的PhenoAge加速。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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