重症COVID-19脑与脉络丛细胞类型失调数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE159812

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管SARS-CoV-2主要影响呼吸系统，但患者及康复者可能遭受神经系统症状。然而，对于COVID-19患者大脑中受影响的细胞和分子过程的无偏见理解仍然缺失。在此，我们从14名对照组（包括1例终末期流感）和8名COVID-19患者的30份额叶皮层和脉络丛样本中，分析了65,309个单核转录组。虽然系统分析未能在脑中发现SARS-CoV-2的分子痕迹，但我们观察到广泛的细胞扰动，这预示着脉络丛屏障细胞感知并将外周炎症传递至大脑，并显示外周T细胞浸润实质。我们发现与COVID-19疾病相关的小胶质细胞和星形胶质细胞亚群，它们与人类神经退行性疾病报道的病理细胞状态有共同特征。在COVID-19中，上层兴奋性神经元的突触信号——在人类中进化扩展并与认知功能相关——优先受到影响。

在不同细胞类型中，COVID-19的扰动与慢性脑部疾病的扰动相重叠，并且存在于与认知、精神分裂症和抑郁症相关的遗传变异中。我们的发现及公共数据集提供了一个分子框架，以理解当前观察到的以及与COVID-19相关的神经性疾病，这些疾病可能日后才会显现。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。