亨廷顿病小鼠模型纹状体星形胶质细胞和小胶质细胞的表达数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE154131

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胶质病理已被认为是导致亨廷顿病特征性纹状体神经元功能障碍和死亡的致病因素。本研究通过小鼠和人纹状体星形胶质细胞，探讨了突变型HTT（mHTT）相关的基因表达变化。小鼠纹状体星形胶质细胞分别从R6/2和zQ175两种不同模型中以FACS分选获得，这两种模型分别表达仅含外显子1的截短型HTT或全长HTT；人星形胶质细胞则分别由表达全长mHTT的人胚胎干细胞（hESC）生成，或由转导了仅含外显子1的mHTT的胎儿纹状体胶质细胞生成。将上述每种条件与其正常HTT对照以及彼此之间进行差异基因表达比较，揭示了截短型和全长mHTT模型中星形胶质细胞特异性的改变，这些改变在两个物种间存在共享之处，但也存在明显区分各模型来源胶质的差异。这些数据集的交集显示，mHTT相关转录失调的模式不仅取决于物种，还取决于星形胶质细胞表达的是截短型还是全长mHTT。

这些数据揭示了一组常见的保守的mHTT相关失调通路，这些通路可能成为挽救亨廷顿舞蹈症中胶质细胞病理的靶点，同时表明表达截短型mHTT的胶质细胞的基因表达可能与表达全长mHTT的胶质细胞存在显著差异。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。