新生小鼠阿片暴露后行为与脑干转录组神经适应的性别差异

该数据集来自 NCBI GEO(GSE141066),研究新生远交系 CFW 小鼠在出生后第 1 至 14 天接受硫酸吗啡(15 mg/kg,皮下注射,每日两次)后,体重变化、行为症状及脑干转录组的性别差异

geo
浏览 2
基因组回归GPL2424710090
GSE141066: Sex differences in behavioral and brainstem transcriptomic neuroadaptations following neonatal opioid exposure in outbred mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

新生小鼠阿片暴露后行为与脑干转录组神经适应的性别差异

Sex differences in behavioral and brainstem transcriptomic neuroadaptations following neonatal opioid exposure in outbred mice

该数据集来自 NCBI GEO(GSE141066),研究新生远交系 CFW 小鼠在出生后第 1 至 14 天接受硫酸吗啡(15 mg/kg,皮下注射,每日两次)后,体重变化、行为症状及脑干转录组的性别差异。数据包含 1 个文件(GSE141066_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序进行表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为 GPL24247。可用于探索新生儿阿片戒断综合征的神经生物学机制、性别特异性转录适应及候选治疗靶点(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 26 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):阿片使用障碍的流行导致阿片依赖母亲所生婴儿中新生儿阿片戒断综合征(NOWS)病例增加。典型特征包括体重减轻、易激惹、难以安抚、失眠和痛觉敏感性增加。NOWS 的神经生物学基础在很大程度上未知。改进的小鼠模型将促进机制和治疗发现。我们在出生后第(P)1 天至 P14 天(约相当于人类妊娠第三孕期)给新生远交系 Cartworth Farms White(CFW)小鼠(Swiss Webster)皮下注射硫酸吗啡(15 mg/kg),每日两次。监测体重减轻,并在 P7 和 P14 吗啡注射后 16 小时测量行为症状。在 P14 收集含脑桥和延髓的脑干,并通过 mRNA 测序(RNA-seq)进行转录组分析。吗啡诱导了从 P2 到 P14 的体重减轻,

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE141066

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 17 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE141066

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿片类药物使用障碍的流行导致阿片依赖母亲所生婴儿中新生儿阿片戒断综合征(NOWS)病例增加。其标志性特征包括体重下降、易激惹、难以安抚、失眠以及痛觉敏感性增加。NOWS的神经生物学基础在很大程度上仍不清楚。改进的小鼠模型将有助于机制研究和治疗发现的推进。我们对新生远交系Cartworth Farms White(CFW)小鼠(Swiss Webster)在出生后第1天(P1)至第14天(P14)期间,每日两次皮下注射硫酸吗啡(15 mg/kg),该时段大致相当于人类妊娠的第三孕期等效阶段。监测体重下降情况,并在P7和P14吗啡给药后16小时测量行为症状。于P14采集含脑桥和延髓的脑干组织,通过mRNA测序(RNA-seq)进行转录组分析。吗啡诱导了P2至P14的体重下降,且该效应持续至P21和P50。重复吗啡给药还诱导了P4时延迟的自我翻正潜伏期,以及P14时持续存在的雌性特异性延迟。吗啡处理的雌性小鼠在P7还表现出超声发声(USVs)的提前增加。

接受吗啡处理的两种性别小鼠在P14均表现出USVs的大幅增加。此外,通过热板和甩尾实验评估的热伤害感受表明,小鼠在P7和P14表现出热痛觉过敏,其中雌性在P7表现出更明显的痛觉过敏(甩尾实验)。接受吗啡处理的小鼠在P21还表现出焦虑样行为(旷场实验)。最后,脑干转录组分析在雄性中鉴定出一组与阿片信号传导相关的经典基因集,而在雌性中鉴定出一组独特的基因集,该基因集富集于核糖体蛋白、线粒体功能和神经退行性疾病。性别特异性的转录组神经适应提示需要性别特异性的治疗。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。