GSE13520:(40,XX)与(39,XO)雌性小鼠表达谱
该数据集来自 NCBI GEO,包含成年 (40,XX) 与 (39,XO) 雌性小鼠四个体细胞组织(脑、肝、肾、肌肉)的全局表达分析数据,共 1 个文件(GSE13520_series_matrix.txt.gz)

基本信息
资源简介
GSE13520:(40,XX)与(39,XO)雌性小鼠表达谱
GSE13520 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达谱数据集,英文全称为 Expression profiles of (40,XX) and (39,XO) females,中文可理解为 (40,XX) 与 (39,XO) 雌性小鼠的表达谱数据。该数据集围绕成年雌性小鼠的四个体细胞组织——脑、肝、肾和肌肉——开展全局表达分析,比较正常 40,XX 个体与 39,XO 个体之间的基因表达差异,目的在于识别哪些基因同时从两条 X 染色体表达,以及哪些基因在 X 染色体单体状态下发生表达失调。数据集在站内归入神经系统疾病 / 其他类别,共包含 1 个数据文件,文件样例为 GSE13520_series_matrix.txt.gz,作者为 Alexandra M. Lopes,发布时间为 Nov 07 200,主题标签涉及表达谱芯片分析、GPL6105 平台与物种编号 10090。
【数据集背景】
X 染色体单体(monosomy X)是一种性染色体数目异常状态,研究其对各组织基因表达的影响有助于理解 X 染色体剂量效应及相关基因调控机制。该数据集正是基于这一背景,选取成年 40,XX 与 39,XO 雌性小鼠作为研究对象,通过全局表达分析比较两种核型在多个体细胞组织中的转录差异,以定位同时从两条 X 染色体表达的基因,以及因 X 染色体单体而表达失调的基因。
【数据内容】
数据集包含成年 (40,XX) 与 (39,XO) 雌性小鼠四个体细胞组织(脑、肝、肾、肌肉)的全局表达分析数据。数据以芯片表达谱形式组织,主题标签中包含 GPL6105 平台标识与物种编号 10090(小鼠)。数据集文件数量为 1,文件样例为 GSE13520_series_matrix.txt.gz,即系列矩阵文件,通常用于汇总各样本的表达值及样本注释信息。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题为 Expression profiles of (40,XX) and (39,XO) females。作者为 Alexandra M. Lopes,发布时间为 Nov 07 200。样本涉及成年 40,XX 与 39,XO 雌性小鼠的脑、肝、肾和肌肉四种体细胞组织。其余采集细节,如具体实验流程、样本数量与处理方式,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究 X 染色体剂量效应与 X 染色体单体状态下的基因表达变化,可用于比较不同核型在脑、肝、肾、肌肉等组织中的表达差异,识别同时从两条 X 染色体表达的基因以及单体状态下失调的基因。由于站内分类涉及神经系统疾病 / 其他,也可作为相关疾病机制探索的参考表达谱资源。
【使用方法】
使用时可下载数据文件 GSE13520_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件,样本规模与实验重复信息源站未提供;发布时间标注为 Nov 07 200,年份信息不完整。其余质量评估信息源站未提供。
【引用与许可】
引用时应注明数据集名称 GSE13520 及作者 Alexandra M. Lopes,来源为 NCBI GEO。许可信息源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE13520
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对成年40,XX和39,XO小鼠四种体组织(脑、肝、肾和肌肉)进行全局表达分析,旨在识别哪些基因从两条X染色体表达,以及在X染色体单体状态下失调的基因。关键词:微阵列表达谱分析
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