GSE13520:(40,XX)与(39,XO)雌性小鼠表达谱

该数据集来自 NCBI GEO,包含成年 (40,XX) 与 (39,XO) 雌性小鼠四个体细胞组织(脑、肝、肾、肌肉)的全局表达分析数据,共 1 个文件(GSE13520_series_matrix.txt.gz)

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL610510090
GSE13520: Expression profiles of (40,XX) and (39,XO) females

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

GSE13520:(40,XX)与(39,XO)雌性小鼠表达谱

GSE13520 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达谱数据集,英文全称为 Expression profiles of (40,XX) and (39,XO) females,中文可理解为 (40,XX) 与 (39,XO) 雌性小鼠的表达谱数据。该数据集围绕成年雌性小鼠的四个体细胞组织——脑、肝、肾和肌肉——开展全局表达分析,比较正常 40,XX 个体与 39,XO 个体之间的基因表达差异,目的在于识别哪些基因同时从两条 X 染色体表达,以及哪些基因在 X 染色体单体状态下发生表达失调。数据集在站内归入神经系统疾病 / 其他类别,共包含 1 个数据文件,文件样例为 GSE13520_series_matrix.txt.gz,作者为 Alexandra M. Lopes,发布时间为 Nov 07 200,主题标签涉及表达谱芯片分析、GPL6105 平台与物种编号 10090。

【数据集背景】

X 染色体单体(monosomy X)是一种性染色体数目异常状态,研究其对各组织基因表达的影响有助于理解 X 染色体剂量效应及相关基因调控机制。该数据集正是基于这一背景,选取成年 40,XX 与 39,XO 雌性小鼠作为研究对象,通过全局表达分析比较两种核型在多个体细胞组织中的转录差异,以定位同时从两条 X 染色体表达的基因,以及因 X 染色体单体而表达失调的基因。

【数据内容】

数据集包含成年 (40,XX) 与 (39,XO) 雌性小鼠四个体细胞组织(脑、肝、肾、肌肉)的全局表达分析数据。数据以芯片表达谱形式组织,主题标签中包含 GPL6105 平台标识与物种编号 10090(小鼠)。数据集文件数量为 1,文件样例为 GSE13520_series_matrix.txt.gz,即系列矩阵文件,通常用于汇总各样本的表达值及样本注释信息。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题为 Expression profiles of (40,XX) and (39,XO) females。作者为 Alexandra M. Lopes,发布时间为 Nov 07 200。样本涉及成年 40,XX 与 39,XO 雌性小鼠的脑、肝、肾和肌肉四种体细胞组织。其余采集细节,如具体实验流程、样本数量与处理方式,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究 X 染色体剂量效应与 X 染色体单体状态下的基因表达变化,可用于比较不同核型在脑、肝、肾、肌肉等组织中的表达差异,识别同时从两条 X 染色体表达的基因以及单体状态下失调的基因。由于站内分类涉及神经系统疾病 / 其他,也可作为相关疾病机制探索的参考表达谱资源。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE13520_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个文件,样本规模与实验重复信息源站未提供;发布时间标注为 Nov 07 200,年份信息不完整。其余质量评估信息源站未提供。

【引用与许可】

引用时应注明数据集名称 GSE13520 及作者 Alexandra M. Lopes,来源为 NCBI GEO。许可信息源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE13520

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

对成年40,XX和39,XO小鼠四种体组织(脑、肝、肾和肌肉)进行全局表达分析,旨在识别哪些基因从两条X染色体表达,以及在X染色体单体状态下失调的基因。关键词:微阵列表达谱分析

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