GSE120440：KMT2B 是神经元转分化所选择性必需的 [RNAseq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE120440

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

通过神经元特异性转录因子Brn2、Myt1l和Ascl1将成纤维细胞转分化为诱导神经元细胞（iNs），是跨表观遗传距离较远的细胞间谱系转换的典型范例。尽管在转分化所依赖的转录层级调控方面已取得巨大进展，但伴随发生的表观基因组重置的促成因素仍有待阐明。本研究通过单独及联合失活的方式，探讨了KMT2A和KMT2B这两个在发育中具有关键作用的组蛋白H3赖氨酸4甲基化酶的作用。我们发现，Kmt2b（其人类同源基因突变可导致肌张力障碍）通过抑制替代性肌细胞程序并诱导神经元成熟基因，对iN转化具有选择性必需作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。