ALS患者与健康对照PBMC综合RNA-Seq图谱

该数据集来自NCBI GEO,包含散发性及FUS、TARDBP、SOD1、C9Orf72、VCP基因突变型ALS患者与健康对照外周血单个核细胞(PBMC)的Illumina RNA-seq数据,旨在从编码RNA和长非编码RNA层面全面刻画PBMC转录组,比较疾病状态与健康对照的差异

geo
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基因组分类GPL185739606
GSE115259: Comprehensive RNA-Seq profiling in PBMCs of ALS patients and healthy controls

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

ALS患者与健康对照PBMC综合RNA-Seq图谱

Comprehensive RNA-Seq profiling in PBMCs of ALS patients and healthy controls

该数据集来自NCBI GEO,包含散发性及FUS、TARDBP、SOD1、C9Orf72、VCP基因突变型ALS患者与健康对照外周血单个核细胞(PBMC)的Illumina RNA-seq数据,旨在从编码RNA和长非编码RNA层面全面刻画PBMC转录组,比较疾病状态与健康对照的差异。数据可用于ALS转录组特征分析、编码与非编码RNA差异表达研究,以及基于易获取组织的RNA表达谱分类建模(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 03 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):编码RNA和长非编码RNA代谢正逐渐揭示其在肌萎缩侧索硬化(ALS)发病机制中的关键作用。本工作对散发性及突变型ALS患者(FUS、TARDBP、SOD1、C9Orf72和VCP基因突变)与健康对照的外周血单个核细胞(PBMC)进行了Illumina RNA-seq分析。我们的目标是对PBMC内容进行全转录组表征,涵盖编码RNA和非编码RNA,以便将疾病状态与健康对照进行比较,既包括散发性患者也包括突变型患者。我们的数据集是全面分析编码RNA和长非编码RNA的起点,所用组织易于提取、管理和储存,显示出作为ALS RNA谱分析合适模型的价值。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:神经系统疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE115259

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 26 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

编码与长链非编码RNA代谢在肌萎缩侧索硬化(ALS)发病机制中的关键作用正逐渐被揭示。本研究对散发性及突变型ALS患者(FUS、TARDBP、SOD1、C9Orf72和VCP基因突变)以及健康对照者的外周血单核细胞(PBMCs)进行了Illumina RNA-seq分析。我们的目标是对PBMCs内容进行全转录组表征,涵盖编码RNA和非编码RNA,以便将散发性患者和突变型患者的疾病状态与健康对照者进行比较。我们的数据集是对编码RNA和长链非编码RNA进行全面分析的起点,所用组织易于采集、处理 and 储存,且被证明是ALS RNA谱分析的合适模型。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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