人脑背外侧前额叶皮层表达数据——含对照样本与重性抑郁障碍样本（28个样本 BA9_M）

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-54567

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

重性抑郁障碍是一种异质性疾病，其病理特征大多尚未明确。大规模基因表达（转录组）分析和针对单核苷酸多态性的全基因组关联研究（GWAS）已产生了大量与基因和疾病相关的信息，但异质性及多种噪声来源限制了疾病机制的发现。随着系统性数据集整合变得日益重要，我们开发了方法，并对来自重性抑郁障碍（MDD）患者和非精神科对照受试者死后脑组织的11项转录组研究中的基因共表达链接进行了元聚类分析。接下来，我们在排名前50的元分析共表达模块中寻找富集，这些模块涉及GWAS针对各类疾病所鉴定的基因。一个包含88个基因的共表达模块与MDD、其他神经精神疾病和脑功能以及临床抑郁风险升高的内科疾病的GWAS持续且显著相关，但与其他疾病无关（详见原文）。

对背外侧前额叶皮层的死后组织进行了分析，共涉及14对样本中的28个样本。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。