实验诱导果蝇活跃睡眠与安静睡眠参与非重叠转录程序

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Abd6906175b4bf8483c9fdc6a48fbe77fa72eb9174b6056395a0a03bdcb05308f

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

哺乳动物的睡眠大致可分为两种不同的生理类别：快速眼动睡眠和慢波睡眠，相应地，人们认为快速眼动睡眠和慢波睡眠实现不同的功能。果蝇正日益被用作理解睡眠功能的模型，尽管目前尚不清楚果蝇大脑是否也涉及不同类型的睡眠。在此，我们比较了两种常用于实验研究果蝇睡眠的方法：光遗传学激活促睡眠神经元和提供促睡眠药物Gaboxadol。我们发现，这些不同的睡眠诱导方法在增加睡眠时长方面具有相似效果，但对大脑活动的影响则存在差异。转录组分析显示，药物诱导的深睡眠（“安静”睡眠）主要下调代谢基因，而光遗传学“主动”睡眠则上调与正常清醒功能相关的广泛基因。这表明……，双光子成像 双光子成像按先前所述方法使用ThorLabs Bergamo系列2多光子显微镜进行。

荧光通过高灵敏度GaAsP光电倍增管（ThorLabs，PMT2000）检测。GCaMP荧光经显微镜内的594二向色分光镜和525/25nm带通滤光片过滤。成像实验中，果蝇被固定于定制支架上。含103 NaCl、10.5海藻糖、10葡萄糖、26 NaHCO3、5 C6H15NO6S、5 MgCl2（六水合物）、2蔗糖、3 KCl、1.5 CaCl（二水合物）和1 NaH2PO4（单位mM）的细胞外液（ECF）在室温下填充果蝇头部上方的腔室。用镊子去除果蝇角质层以暴露大脑，并用微刺针去除神经周鞘。实验开始前，让果蝇恢复一小时。成像在18个z切片上进行，切片间隔6µm，另加两个额外的回扫f

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。