示例 nidmfsl 输出

该数据集是一个由 nidmfsl 工具生成的 NIDM-Results 数据包,生成过程与 FSL 5.0.11 中内置的 fsl-python 版本相关,生成日期为 2018 年 7 月 6 日

neurovault
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文本神经系统疾病NIDM-ResultsnidmfslFSLneurovault.orgFEAT
Example nidmfsl output

基本信息

模态
文本
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

示例 nidmfsl 输出

本数据集英文名为 Example nidmfsl output,属于神经系统疾病 / 其他分类,来源于 neurovault.org。该数据集是一个由 nidmfsl 工具生成的 NIDM-Results 数据包,生成过程与 FSL 5.0.11 中内置的 fsl-python 版本相关,生成日期为 2018 年 7 月 6 日。其原始 FEAT 报告取自 nidmresults-examples 仓库,并通过一系列命令行操作完成转换与打包。数据集主题涵盖神经系统疾病领域,面向公开获取与使用,适合对神经影像结果标准化表示、元数据交换以及可重复分析流程感兴趣的研究人员参考。整体而言,该数据集体现了将 FSL 统计结果转化为 NIDM-Results 格式的典型实践,为神经影像数据的共享与再利用提供了示例。

【数据集背景】

该数据集属于神经系统疾病 / 其他分类,来源站为 neurovault.org。其核心背景与 NIDM-Results 数据包相关。NIDM-Results 是一种用于表示神经影像统计结果的标准化数据模型,旨在促进结果的可交换、可重复与可理解。本数据包由 nidmfsl 工具生成,而 nidmfsl 是 FSL 生态中用于将 FEAT 分析结果导出为 NIDM-Results 格式的组件。生成时所使用的 nidmfsl 版本内置于 fsl-python,并作为 FSL 5.0.11 的一部分。生成日期为 2018 年 7 月 6 日。原始 FEAT 报告来自 nidmresults-examples 仓库,该仓库通常用于提供示例数据以演示 NIDM-Results 的生成与使用。数据集主题涵盖神经系统疾病领域,因此其背景与神经影像统计结果标准化、神经疾病相关研究的数据共享实践密切相关。

【数据内容】

本数据集是一个 NIDM-Results 数据包,由 nidmfsl 工具生成。其内容基于一份 FEAT 报告转换而来,该 FEAT 报告取自 nidmresults-examples 仓库。数据包的具体内容结构、包含的文件类型、统计图、坐标表、元数据字段等细节,源站未提供。数据集分类为神经系统疾病 / 其他,主题涵盖神经系统疾病。由于源站描述仅说明了生成工具、版本、日期和来源仓库,未进一步列出数据包内部的具体内容项,因此无法确认其包含的对比、体素阈值、簇水平信息或解剖标注等细节。整体上,该数据集可被视为一个示例性的 NIDM-Results 输出,用于展示从 FEAT 报告到标准化结果包的转换结果。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 neurovault.org。其原始 FEAT 报告来自 nidmresults-examples 仓库,具体获取方式在源站描述中通过完整数据集 URL 指向。生成过程使用了 FSL 5.0.11 中内置的 fsl-python 版本的 nidmfsl。源站描述中给出的命令序列包括:激活 fslpython 环境,使用 pip 安装或升级 nidmfsl,并执行 nidmfsl 命令,其中包含参数 -g 'Control' 14。这些命令表明生成过程涉及指定组别标签“Control”以及一个数值参数 14。生成日期为 2018 年 7 月 6 日。除上述信息外,采集设备、受试者数量、扫描参数、伦理审批等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于神经影像统计结果标准化相关的场景。由于它是一个 NIDM-Results 数据包,可用于演示或测试 NIDM-Results 格式的读取、解析、可视化或转换流程。其主题涵盖神经系统疾病,因此可能对神经系统疾病领域的神经影像研究结果共享与元数据交换具有参考价值。此外,由于原始 FEAT 报告来自 nidmresults-examples 仓库,该数据集也可用于教学、工具开发或方法学比较,帮助研究人员理解如何将 FSL FEAT 结果导出为 NIDM-Results。具体适用场景的详细说明,源站未提供。

【使用方法】

源站描述中提供了生成该数据集所使用的命令序列,包括激活 fslpython、安装或升级 nidmfsl,以及运行 nidmfsl 并指定参数 -g 'Control' 14。这些命令可用于复现该数据包的生成过程。对于使用该数据集的研究人员,通常需要具备 FSL 环境或能够解析 NIDM-Results 的工具。数据集的获取方式可通过 neurovault.org 上的完整数据集 URL 进行。除上述命令和来源信息外,具体的加载、查询或分析步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集由 nidmfsl 工具自动生成,生成过程基于 FSL 5.0.11 和 fsl-python 内置版本。其原始 FEAT 报告来自 nidmresults-examples 仓库,该仓库通常用于示例目的。因此,该数据集可能主要作为示例或演示用途,而非特定临床或科学结论的直接依据。数据包的具体质量指标、验证结果、误差范围或局限性说明,源站未提供。此外,由于源站描述未列出受试者群体、扫描协议或统计模型细节,无法评估其外部效度或泛化能力。使用时应结合原始 FEAT 报告和生成命令进行理解。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 neurovault.org,原始 FEAT 报告来自 nidmresults-examples 仓库。源站描述中提及了完整数据集 URL,但未提供具体的引用格式、作者列表、许可条款或使用限制。因此,关于引用与许可的详细信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应参考 neurovault.org 上该数据集的页面以及 nidmresults-examples 仓库的相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://neurovault.org/collections/3993

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本NIDM-Results包是使用FSL 5.0.11中fsl-python内置的nidmfsl版本于2018年7月6日生成的。用于生成此数据集的FEAT报告来源于nidmresults-examples仓库(见完整数据集URL)。获取该报告使用了以下命令:source $FSLDIR/fslpython/bin/activate fslpython pip install nidmfsl --user --upgrade --upgrade-strategy only-if-needed nidmfsl -g ‘Control’ 14

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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