球形胶质细胞tau蛋白病及一例典型对照的人脑半球离体MRI

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A68df916fbf37e009f119ae5a5d4330e49a259946aa1c453a97f1ad4ea8f77198

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

6个人脑半球的离体全半球T2*加权MRI，其中5个来自球形胶质tau蛋白病（GGT）患者，1个来自正常衰老患者。MRI数据以NIFTI文件存储，每个半球一个文件。梯度回波时间选择约为20毫秒，以最大化对GGT病理的敏感性。样本置于Fomblin（California Vacuum Technology；Freemont，CA）中，这是一种质子自由液体，其体积磁化率接近组织。样本被封闭在定制圆柱形支架或塑料袋中，然后静置至少两天，以便气泡从组织中逸出。根据样本大小，使用定制鸟笼线圈或定制改装的正交鸟笼线圈（Varian，Palo Alto，CA，USA）进行扫描。这些发射/接收线圈连接到一个双通道发射-接收适配器（Stark Contrast，Erlangen，Germany）。

选择能容纳每个样本的最小线圈，手动调谐/匹配，然后将其放入我们的全身7 T扫描仪（MAGNETOM Terra，Siemens Healthineers，Erlangen，Germany）中，使用线圈下方的塑料垫片将样本定位在等中心附近。MRI数据采用三维编码、多回波梯度回波（GRE）序列采集，非选择性…，# 来自球形胶质tau蛋白病患者及一名典型对照的人脑半球离体MRI 数据集DOI：10.5061/dryad.dbrv15fgk ## 数据和文件结构描述 有关此数据集的问题，请联系Dylan Tisdall（mtisdall@pennmedicine.upenn.edu）。图像数据为NIFTI格式，按每位患者一个文件组织。成像数据维度在NIFTI数据头中描述。具体成像参数的详细信息以及患者的临床和人口统计信息包含在相关手稿中。 ### 文件和变量 #### 文件：sub-patient1_acq-

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。