Di-8-ANEPPS 与频闪荧光显微镜用于膜电压成像的兼容性评估

主题标签:神经系统疾病、膜电压成像、荧光显微镜、Di-8-ANEPPS、神经生理学、NWB、BRAIN Initiative

dandi
2025-06-27 更新
浏览 18
医学影像神经系统疾病膜电压成像荧光显微镜Di-8-ANEPPS神经生理学NWBBRAIN Initiative
Evaluation of Di-8-ANEPPS Compatibility with Strobe Fluorescence Microscopy for Membrane Voltage Imaging

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2025-06-27
版本
0.261006.1856

资源简介

Di-8-ANEPPS 与频闪荧光显微镜用于膜电压成像的兼容性评估

该数据集名为 Evaluation of Di-8-ANEPPS Compatibility with Strobe Fluorescence Microscopy for Membrane Voltage Imaging,收录于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 中的 dandiset 001517。它属于神经生理学数据范畴,遵循 NWB 标准,并与 BRAIN Initiative 相关。数据集的主题标签涵盖神经系统疾病、膜电压成像、荧光显微镜、Di-8-ANEPPS、神经生理学、NWB 以及 BRAIN Initiative。联系人信息为 Silkuniene, Giedre。本站将其归类于神经系统疾病 / 其他。整体而言,该数据集围绕膜电压成像中 Di-8-ANEPPS 与频闪荧光显微镜的兼容性评估展开,面向神经科学领域中对膜电位光学记录感兴趣的研究人员。

【数据集背景】

该数据集来自 dandiarchive.org,属于 DANDI Archive 中的 dandiset 001517。DANDI Archive 是 BRAIN Initiative 相关的神经生理学数据发布平台,该数据集遵循 NWB 标准,因此其组织方式与神经生理学数据社区常用的标准化格式一致。数据集的主题标签包括神经系统疾病、膜电压成像、荧光显微镜、Di-8-ANEPPS、神经生理学、NWB 和 BRAIN Initiative。从名称来看,其关注点是评估 Di-8-ANEPPS 这一膜电压敏感染料与频闪荧光显微镜在膜电压成像中的兼容性。关于该数据集的具体研究动机、实验假设或项目背景,源站未提供。

【数据内容】

该数据集被描述为 NWB 标准的神经生理学数据集,属于 BRAIN Initiative 相关数据。其主题标签涉及膜电压成像、荧光显微镜、Di-8-ANEPPS 以及神经系统疾病。数据集名称表明其内容与 Di-8-ANEPPS 和频闪荧光显微镜用于膜电压成像的兼容性评估有关。关于数据的具体模态组成、文件数量、记录通道、时间跨度、样本类型或具体实验条件,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 001517。源站将其标注为 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。联系人信息为 Silkuniene, Giedre。关于采集设备的具体型号、频闪荧光显微镜的参数、Di-8-ANEPPS 的使用浓度或染色方案、实验动物或样本的详细信息,以及采集地点和采集时间,源站未提供。

【适用场景】

基于数据集的主题标签和名称,该数据集可能适用于神经生理学中与膜电压成像相关的研究场景,尤其是涉及 Di-8-ANEPPS 和频闪荧光显微镜兼容性评估的工作。其 NWB 标准格式也使其适合在支持 NWB 的神经数据分析流程中使用。由于本站分类为神经系统疾病 / 其他,该数据集也可能与神经系统疾病相关研究有所关联。关于该数据集具体支持的分析任务、可复现的实验流程或已验证的应用方向,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 NWB 标准组织,并发布在 DANDI Archive 上,因此通常可通过 DANDI Archive 的访问方式获取和使用。使用者可依据 NWB 生态中的常见工具读取和处理该数据集。关于该数据集的具体下载方式、访问链接、所需软件版本、数据处理步骤或分析示例,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集被标注为 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关,这为其格式规范性提供了一定背景。联系人信息为 Silkuniene, Giedre。关于数据质量的具体指标、缺失情况、噪声水平、验证结果、已知偏差或使用限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 001517。关于该数据集的引用格式、作者列表、版本号、DOI、许可协议或使用条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001517

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001517. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Silkuniene, Giedre.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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