建立感觉神经元作为多聚谷氨酰胺扩展ATXN3驱动的周围神经病变治疗靶点

主题标签:神经系统疾病、周围神经病变、ATXN3、感觉神经元、神经生理学、NWB、BRAIN Initiative。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖神经系统疾病。

dandi
2025-10-06 更新
浏览 17
基因组神经系统疾病周围神经病变ATXN3感觉神经元神经生理学NWBBRAIN Initiative
Establishing Sensory Neurons as Therapeutic Targets in Peripheral Neuropathy Driven by Polyglutamine Expanded ATXN3

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2025-10-06
版本
0.251208.0008

资源简介

建立感觉神经元作为多聚谷氨酰胺扩展ATXN3驱动的周围神经病变治疗靶点

该数据集英文名为 Establishing Sensory Neurons as Therapeutic Targets in Peripheral Neuropathy Driven by Polyglutamine Expanded ATXN3,收录于 DANDI Archive,编号为 dandiset 001621,属于神经系统疾病领域下的公开数据集,分类归入“神经系统疾病 / 其他”。从主题上看,该数据集围绕神经系统疾病、周围神经病变、ATXN3、感觉神经元、神经生理学等关键词展开,并采用 NWB 标准组织神经生理学数据,与 BRAIN Initiative 相关。数据集联系人信息为 McLoughlin, Hayley。整体而言,该数据集面向由多聚谷氨酰胺扩展型 ATXN3 驱动的周围神经病变研究,关注感觉神经元作为治疗靶点的可能性,适合对相关神经生理机制感兴趣的科研人员参考使用。

【数据集背景】

该数据集的主题聚焦于神经系统疾病中的周围神经病变,并特别指向由多聚谷氨酰胺扩展型 ATXN3 所驱动的病理过程。ATXN3 是多聚谷氨酰胺疾病相关的重要基因,当其发生多聚谷氨酰胺扩展时,可能引发一系列神经系统的异常改变。该数据集将感觉神经元置于研究核心,试图从治疗靶点的角度探讨其在周围神经病变中的作用。数据集来源站为 dandiarchive.org,源站描述中将其标注为 DANDI Archive dandiset 001621,并说明其属于 NWB 标准的神经生理学数据集,与 BRAIN Initiative 相关。这些信息共同勾勒出该数据集在神经科学、尤其是周围神经病变研究领域中的基本定位。

【数据内容】

该数据集属于神经生理学数据,采用 NWB 标准进行组织。其主题标签涵盖神经系统疾病、周围神经病变、ATXN3、感觉神经元、神经生理学、NWB 以及 BRAIN Initiative。数据集内容围绕感觉神经元在由多聚谷氨酰胺扩展型 ATXN3 驱动的周围神经病变中的角色展开,旨在为将感觉神经元确立为治疗靶点提供数据支持。关于具体的记录类型、通道数量、采样率、实验条件、动物模型或受试者信息等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,源站描述中标注其为 DANDI Archive dandiset 001621,属于 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。联系人信息为 McLoughlin, Hayley。关于采集设备、采集地点、实验方案、伦理审批信息以及具体的采集时间等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于神经系统疾病领域的研究,尤其是与周围神经病变、ATXN3 相关病理机制以及感觉神经元功能相关的神经生理学分析。由于采用 NWB 标准,该数据集可被支持 NWB 格式的工具和流程读取,便于进行数据共享、复用和再分析。其主题涉及将感觉神经元作为治疗靶点,因此也可能适用于探索潜在干预靶点、比较神经生理特征或开展二次分析的研究场景。关于具体的适用分析类型或推荐研究问题,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 NWB 标准组织,可通过 DANDI Archive 平台获取,编号为 dandiset 001621。使用者可借助支持 NWB 格式的常见神经生理学数据处理工具进行读取、浏览和分析。关于具体的下载方式、访问权限、所需软件版本、代码示例或处理流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集来自 DANDI Archive,属于 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关,这些信息表明其在数据组织上遵循一定的社区标准。然而,关于数据质量评估、完整性、样本量、潜在偏差、缺失数据情况以及使用时的具体限制,源站未提供。使用者应结合自身研究目的,对数据的适用性进行独立判断。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 dandiarchive.org,源站描述中标注了 DANDI Archive dandiset 001621,联系人为 McLoughlin, Hayley。关于具体的引用格式、DOI、许可协议类型以及使用条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应前往 DANDI Archive 对应页面查阅最新的引用与许可信息。

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源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001621

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001621. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: McLoughlin, Hayley.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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