高危人群中急性HIV感染队列的建立与特征分析

该数据集来源于clinicaltrials.gov,聚焦急性HIV感染,旨在高危人群中建立以非B亚型为主的急性感染队列。数据涉及通过第四代或敏感EIA初筛后,采用集合或个体NAT对血浆或干血斑进行急性HIV感染筛查,并包含对第四代反应性样本的进一步筛查

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clinicaltrials
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医学影像Acute HIV Infection疫苗编码
Establish and Characterize an Acute HIV Infection Cohort in a High Risk Population

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

高危人群中急性HIV感染队列的建立与特征分析

该数据集英文名为“Establish and Characterize an Acute HIV Infection Cohort in a High Risk Population”,来源于clinicaltrials.gov,聚焦急性HIV感染(Acute HIV Infection),旨在高危人群中建立以非B亚型为主的急性感染队列。其核心价值在于通过系统筛查识别急性HIV-1感染者,为HIV疫苗研发和HIV-1免疫发病机制研究提供基础。数据涉及在受试者寻求自愿咨询检测(VCT)时收集接触信息,并对血浆或干血斑样本先以可同时检测HIV抗体和抗原的第四代或敏感EIA初筛,再对初筛无反应样本采用集合或个体NAT进行急性感染筛查,同时对第四代反应性样本作进一步筛查。本站将其归类为神经系统疾病/其他。

【数据集背景】

该数据集围绕急性HIV感染的早期事件展开。源站描述指出,描述HIV感染的早期事件对于HIV疫苗开发以及理解HIV-1免疫发病机制至关重要。建立这样一个急性感染队列并识别出急性HIV-1感染者,将为未来由假设驱动的研究提案提供基础。该队列以非B亚型为主,受试者在TRCARC招募。这一背景决定了数据集的核心目标不是一般性的HIV感染监测,而是聚焦于感染早期阶段的高危人群队列建设与特征刻画。

【数据内容】

数据集的主题标签为急性HIV感染。其内容涉及受试者招募与接触信息的收集,以及实验室筛查检测结果。检测对象包括血浆或采集于滤纸上的全血(即干血斑,DBS)。筛查流程包含两个层次:首先使用能够同时检测HIV抗体和抗原的第四代或敏感EIA进行初筛;对于初筛无反应的样本,再通过集合或个体NAT筛查急性HIV感染;对于第四代检测呈反应性的样本,则进行非IgM敏感检测的进一步筛查。源站未提供具体的样本量、受试者人数、检测结果数值或统计指标。

【采集与来源】

数据来源于clinicaltrials.gov所描述的研究。受试者在TRCARC招募,寻求VCT的受试者会被要求提供接触信息。生物样本为血浆或干血斑形式的全血。样本检测按照上述EIA初筛、NAT筛查和第四代反应性样本进一步筛查的流程进行。源站未提供采集时间跨度、采样频率、地理范围或伦理审批等具体信息。

【适用场景】

基于源站描述,该数据集适用于急性HIV感染早期事件的研究,尤其是面向HIV疫苗开发和HIV-1免疫发病机制理解的基础研究。由于队列以非B亚型为主,其数据可用于支持未来由假设驱动的研究提案,并可作为识别急性HIV-1感染者的筛查流程参考。源站未提供其他具体应用场景。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法、访问方式或分析指南。仅可依据源站描述了解其筛查检测流程,即第四代或敏感EIA初筛、对无反应样本进行集合或个体NAT筛查、对第四代反应性样本进行非IgM敏感检测的进一步筛查。源站未提供数据格式、变量字典或分析工具等信息。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、完整性、准确性或验证情况的信息。可确认的限制性信息包括:队列以非B亚型为主,受试者来源于TRCARC,筛查依赖EIA与NAT的组合流程。源站未提供样本量、缺失率、偏倚控制或质量控制措施等具体内容。

【引用与许可】

源站未提供引用方式、许可条款或数据使用协议等信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT00796146

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:急性HIV感染。本研究将建立一个以非B亚型为主的急性感染队列。描述HIV感染的早期事件对于HIV疫苗研发和理解HIV-1免疫发病机制至关重要。建立该队列并识别急性HIV-1感染个体的能力,将为未来以假说为驱动的研究提案提供基础。受试者将在TRCARC招募。寻求VCT的受试者将被要求提供联系信息。血液样本,无论是血浆还是采集于滤纸上的全血(干血斑,DBS),将先经能够同时检测HIV抗体和抗原的EIA(第四代或敏感EIA)筛查,若呈无反应,则通过混合或个体NAT筛查急性HIV感染。此外,第四代EIA呈反应的样本将在样本采集后1-2天内,用仅能检测HIV抗体、对IgM不敏感的非IgM敏感EIA(低敏感EIA)进行筛查。被发现有急性HIV感染者将被邀请加入该队列研究。

这些急性HIV感染者将在第0周、第2、3、5、7、10天,随后在第2、4、8、12、16、20、24周,之后每12周进行前瞻性随访,直至研究结束(最长随访192周)。受试者将接受CD4、HIV RNA、ALT、肌酐和血脂的血液检测,以及尿液分析。受试者将被要求完成一份关于HIV风险行为的问卷。将进行血浆和PBMC的存档,以供未来免疫学和病毒学检测使用。可选的研究程序包括:1)采集生殖道分泌物;2)采集脑脊液;3)不注射钆的脑MRI/MRS;4)通过结肠活检采集肠道相关淋巴组织;5)基因检测;6)追踪急性HIV感染受试者的性接触者并提供自愿咨询检测(VCT)。鼓励受试者在最初3-7天住院,以便进行术后观察和便于随访。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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