体内解析人类NRXN1异构体揭示精神分裂症相关3'缺失的功能获得性致病性

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A1156d237b4f0600558943f332ea06ee6dc91f05e8721e3b6bb77353dfc589aa0

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

NRXN1编码突触前黏附分子Neurexin 1，其杂合缺失是精神分裂症及其他神经精神疾病中最常见的罕见变异之一。患者测序显示，NRXN1内的3′缺失会产生完整位点不产生的新异构体，但这些异构体在体内是有功能的、被动无功能的，还是主动致病的，目前仍不清楚。为解决这一问题，我们在秀丽隐杆线虫神经元中表达了八种人类NRXN1异构体，包括四种对照异构体和四种在精神分裂症患者细胞系中鉴定出的3′缺失变异异构体，并表征了它们对蛋白质定位以及两种独立行为的影响：食物剥夺反应和社会性摄食行为。大多数人类异构体在神经环和神经元中的表达与定位与C.相似。

秀丽隐杆线虫同源基因NRX-1；然而，若干异构体，尤其是在3’缺失变异体中，表现出异常……，# 数据来源：体内剖析人类NRXN1异构体揭示精神分裂症相关3’缺失的功能获得性致病性 数据集DOI：10.5061/dryad.2z34tmq32 ## 数据及文件结构描述 与人类NRXN1异构体在秀丽隐杆线虫中表达相关的行为学和qRT-PCR数据。此文件包含4个电子表格，这些数据用于生成图3、图4以及补充图2和3。 ### 文件：Haskell_HMG_data_dryad_.xlsx 描述： 用于生成相关出版物中图3、图4及补充图2和3图表的数据，共4个电子表格。 #### 表格：图3 描述：比较对照组、nrx-1(wy778)突变体以及在nrx-1(wy778)突变体中表达指定NRXN1异构体对饥饿状态下活动水平的影响，活动水平通过WorMotel行为装置中单个动物孔内的测量得出。数值表示每孔（单个动物）在8分钟内的归一化平均活动量。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。