人类早期重症疾病转化生物学信息学数据集

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05591924

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

病症：脓毒症、急性呼吸窘迫综合征、危重症、神经认知功能障碍、感染性休克、呼吸机相关性肺炎、免疫抑制、炎症。背景：危重症综合征，如脓毒症和急性呼吸窘迫综合征，在患者易感风险因素、导致感染的急性损伤机制、临床表现、对治疗的反应以及短期和长期预后方面存在巨大的异质性。自30多年前首次对脓毒症和急性呼吸窘迫综合征进行标准化定义以来，人们对导致危重症综合征的生物学机制已有了重要认识。然而，仍有许多重要的未解问题阻碍了对因早期症状符合危重症而入住ICU的患者进行准确诊断、治疗和预后判断。

在脓毒症和ARDS生物学中仍有许多未解之谜，以下问题尤为重要：（1）免疫系统失调的构成是什么；（2）免疫系统反应如何依赖于与感染病原体的相互作用；（3）哪些生物学特征能够区分模拟这些综合征的其他诊断；（4）遗传多态性在患者预后中的机制是什么。为了解决这些问题并增进我们对这些复杂且异质性综合征的理解，需要采取多方面协作的方法。本研究将通过建立一个名为“人类早期重症转化生物学信息学”（ESTABLISH）的纵向前瞻性观察队列，来研究危重患者早期脓毒症的生物学。具体目标：目标1：研究早期危重疾病期间免疫系统调节的生物学机制。

将要解决的主要问题包括：(1) 入院时及ICU住院期间免疫功能与临床并发症的关系；(2) 免疫反应的解剖区室化与临床并发症的关联；(3) 不同解剖位置的免疫反应如何导致内皮细胞损伤；(4) 巨噬细胞如何促进

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。