功能性消化不良十二指肠微生物群数据集
该数据集来源于 clinicaltrials.gov，聚焦功能性消化不良（FD）患者的十二指肠黏膜相关微生物组（MAM）
基本信息
资源简介
功能性消化不良十二指肠微生物群数据集
该数据集英文名为 Duodenal Microbiota in Functional Dyspepsia，来源于 clinicaltrials.gov，主题标签为 Functional Dyspepsia，在本站归类于神经系统疾病 / 其他。数据集聚焦功能性消化不良（FD）患者的十二指肠黏膜相关微生物组（MAM），围绕 FD 患者与健康对照之间十二指肠微生物群差异这一尚不明确的问题展开。功能性消化不良在内镜检查中无可检测的结构异常，却显著影响健康相关生活质量；肠脑轴失调被认为参与 FD 的动力障碍、内脏高敏感及黏膜/免疫功能改变。该数据集为相关研究提供了以十二指肠黏膜相关微生物组为核心的数据资源，可用于探索 FD 与肠道微生物之间的关系。
【数据集背景】
功能性消化不良是一种常见的胃肠道疾病，在全球人群中影响范围较大，源站描述提到其在泰国的患病率可高达 66%。FD 的特征是在内镜检查期间未发现可检测的结构异常，同时显著影响健康相关生活质量。肠脑轴失调被假设与 FD 中的动力障碍、内脏高敏感以及黏膜/免疫功能变化有关。近年来的研究已对功能性消化不良患者的十二指肠黏膜相关微生物组（MAM）进行了刻画，但 FD 患者与健康对照之间的十二指肠微生物群差异仍不清楚，且已有结果相互矛盾。评估这一问题的研究数量有限，因此需要设计良好的研究来比较功能性消化不良患者的十二指肠微生物群。该数据集正是在这一研究背景下产生，主题聚焦于 FD 患者的十二指肠黏膜相关微生物组。
【数据内容】
该数据集的核心内容围绕功能性消化不良患者的十二指肠黏膜相关微生物组（MAM）展开，主题标签为 Functional Dyspepsia。源站描述指出，近年研究已对 FD 患者的十二指肠 MAM 进行刻画，但 FD 患者与健康对照之间的十二指肠微生物群比较结果仍不明确且存在冲突。数据集所涉及的具体样本数量、微生物组检测方法、测序数据格式、变量字段及统计指标等，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 clinicaltrials.gov，本站分类为神经系统疾病 / 其他。源站描述提及的研究对象为功能性消化不良患者，并涉及与健康对照的比较；研究关注的是内镜检查无可检测结构异常的 FD 人群的十二指肠黏膜相关微生物组。关于具体的采集地点、采集时间、样本采集流程、伦理审批信息及数据收集机构等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕功能性消化不良与十二指肠黏膜相关微生物组的研究场景，例如探讨 FD 患者与健康对照之间十二指肠微生物群差异、分析肠脑轴失调与黏膜/免疫功能变化的关系，以及为设计良好的比较研究提供数据基础。由于源站描述强调该领域研究数量有限且结果相互矛盾，该数据集也可用于相关主题的回顾性参考或研究设计参考。具体可支持的分析类型与建模任务，源站未提供。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明，包括数据访问方式、文件组织格式、字段说明、预处理步骤及分析工具等均未在源站描述中体现。使用者需依据来源站 clinicaltrials.gov 的相关登记信息自行确认获取与使用条件。
【质量与限制】
该数据集所对应的研究领域存在明确限制：FD 患者与健康对照之间的十二指肠微生物群比较结果仍不清楚且相互矛盾，评估该问题的研究数量有限。源站描述未提供样本量、检测方法、数据完整性、质控指标或偏倚控制等具体质量信息，这些内容源站未提供。此外，数据集在本站归类为神经系统疾病 / 其他，其分类依据与覆盖范围的具体界定，源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供引用格式、许可协议、数据使用条款或版权归属等信息。使用者在引用或再利用该数据集前，应通过来源站 clinicaltrials.gov 查询相关登记记录以确认引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT06326918
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
条件：功能性消化不良。消化不良是一种常见的胃肠道疾病，影响全球相当一部分人群，在泰国的患病率高达66%。功能性消化不良（FD）的特征是内镜检查未发现可检测的结构异常，并显著影响健康相关生活质量。据推测，肠-脑轴失调可导致FD患者的动力障碍、内脏高敏感性和黏膜/免疫功能改变。近期研究已对功能性消化不良（FD）患者十二指肠黏膜相关微生物组（MAM）的微生物群进行了特征描述。然而，与健康对照相比，FD患者的十二指肠微生物群仍不明确，且结果相互矛盾。评估这一问题的研究数量有限，一项设计良好的研究比较功能性消化不良患者与对照组的十二指肠微生物群，将增进我们对微生物组在FD中潜在作用的理解。因此，本研究旨在比较FD患者与无上消化道症状者的十二指肠微生物群。
本研究为试点阶段、横断面、病例对照研究，旨在通过黏膜刷采样和黏膜活检采样，评估功能性消化不良患者与非功能性消化不良患者相比的微生物群特征。研究方案包括：年龄、性别、BMI、吸烟史、2周内PPI使用史、4周内抗生素使用史、4周内益生菌使用史将记录于病例报告表中。在获得知情同意后，将进行标准EGD。将分别使用无菌护套刷进行十二指肠黏膜刷采样，并使用标准活检钳进行十二指肠黏膜活检。十二指肠黏膜标本将置于无菌管中，并立即于-80℃冷冻保存（允许室温放置<2小时），用于16sRNA测序分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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