人类海马灌注与微血管搏动性的年龄相关空间组织数据集
该数据集来自 openneuro.org,包含 35 名被试的静息态 MRI 原始数据,用于研究人类海马灌注与微血管搏动性随年龄变化的空间组织

基本信息
资源简介
人类海马灌注与微血管搏动性的年龄相关空间组织数据集
该数据集英文名为“Distinct spatial organization of human hippocampal perfusion and microvascular pulsatility across age”,来源于 openneuro.org,共包含 35 名被试的静息态 MRI 原始数据,用于研究人类海马灌注与微血管搏动性随年龄变化的空间组织。数据涵盖结构像、动脉像、灌注加权像及血容量相关图像等多种模态,并附有经定制重建的衍生图像。数据集采用 CC0 许可发布,DOI 为 doi:10.18112/openneuro.ds008942.v1.0.0,发布时间为 2026-10-15,主题标签为 mri,本站归类为神经系统疾病 / 其他。
【数据集背景】
该数据集围绕人类海马区域的灌注与微血管搏动性展开,关注这两类血管生理特征在不同年龄阶段的空间组织差异。源站描述中引用了 F. Guo、A.J. Kim、C. Zhao 等人的论文《Distinct spatial organization of human hippocampal perfusion and microvascular pulsatility across age》(BioRxiv, 2026),说明该数据是为上述研究采集的原始 MRI 数据。数据集作者包括 Fanhua Guo、Andy Jeesu Kim、Chenyang Zhao、Tanxin Dong、Zixuan Liu、Zidong Yang、Kay Jann、Xingfeng Shao、Neda Jahanshad、Mara Mather 与 Danny JJ Wang。
【数据内容】
数据集包含 35 名被试的静息态 MRI 数据,模态标注为 mri。源站描述列出了四类主要图像:其一,sub-XX_ses-XX_T1w.nii.gz 为采用 MP2RAGE 采集的解剖图像;其二,sub-XX_ses-XX_TOF.nii.gz 为采用 TOF 采集的动脉图像;其三,derivatives 文件夹中的 sub-XX_ses-XX_task-rest_acq-asl_run-01_desc-cbf/control.nii.gz 为采用 ASL 采集并经定制重建得到的 CBF/control 图像;其四,sub-XX_ses-XX_task-rest_run-01_bold/cbv.nii.gz 为采用 SS-SI VASO 采集的 BOLD/VASO 图像。数据组织采用 sub-XX 与 ses-XX 的命名结构,任务标注为 rest。
【采集与来源】
数据来源于 openneuro.org,采集任务为静息态,采集技术包括 MP2RAGE、TOF、ASL 与 SS-SI VASO,分别对应解剖图像、动脉图像、灌注相关图像以及 BOLD/VASO 图像。源站描述中说明了 ASL 图像位于 derivatives 文件夹并经过定制重建。其余采集参数、扫描设备型号、站点信息及扫描序列细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究人类海马灌注与微血管搏动性的空间组织及其随年龄的变化,也可用于涉及脑血流、动脉血管成像与血容量加权成像的方法学探索。由于包含静息态数据与多种血管相关模态,可用于分析 ASL 重建的 CBF/control 图像、TOF 动脉图像以及 SS-SI VASO 的 BOLD/VASO 图像。具体分析范式与统计设计应结合源站引用的论文确定,源站未提供额外的适用场景说明。
【使用方法】
使用者可按照 sub-XX 与 ses-XX 的命名规则定位各被试、各 session 的图像文件;解剖图像、动脉图像与静息态功能类图像分别以 T1w、TOF、task-rest 等标识区分。ASL 相关的 CBF/control 图像需在 derivatives 文件夹中查找,BOLD/VASO 图像以 bold/cbv 标识。数据下载与使用应遵循 openneuro.org 的平台流程。源站未提供具体的预处理步骤、分析代码或使用教程。
【质量与限制】
数据集共 35 名被试,样本量信息明确;源站描述未提供数据质量评估指标、排除标准、年龄分布或扫描参数等细节。由于数据为原始 MRI 数据,使用前通常需要自行完成预处理与质量控制。数据集仅包含静息态任务,未提及其他任务条件。源站未提供关于数据完整性、缺失情况或已知伪影的说明。
【引用与许可】
使用该数据集应引用源站所列论文:F. Guo, A.J. Kim, C. Zhao, et al. Distinct spatial organization of human hippocampal perfusion and microvascular pulsatility across age. BioRxiv, 2026。数据集许可为 CC0,DOI 为 doi:10.18112/openneuro.ds008942.v1.0.0,发布时间为 2026-10-15。源站未提供其他引用要求或使用限制说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://openneuro.org/datasets/ds008942
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 33.11 GB。
数据说明
OpenNeuro dataset ds008942. Modalities: mri. DX status: Healthy / Control. BIDS-standardized neuroimaging dataset (MRI/EEG/MEG/PET).
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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