DGAT1与多发性硬化及实验性自身免疫性脑脊髓炎中致病性T细胞程序相关

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23674102

标准获取流程：

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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

用于以下研究的原始流式细胞术数据（FCS文件）：DGAT1与多发性硬化症及实验性自身免疫性脑脊髓炎中的致病性T细胞程序相关。本数据集包含《DGAT1与多发性硬化症及实验性自身免疫性脑脊髓炎中的致病性T细胞程序相关》（已投稿至PeerJ）图3C–3F和图4D–4E所依据的原始流式细胞术数据。该研究考察二酰甘油O-酰基转移酶-1（DGAT1）与自身免疫性神经炎症之间的关系。FoxP3-GFP Dgat1缺陷小鼠表现出外周淋巴结增大，调节性T细胞（Tregs）的频率和绝对数量增加，并且与野生型对照相比，实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）的病情较轻。数据来自FoxP3-GFP报告小鼠，这些小鼠为Dgat1野生型、杂合子或敲除型。图3涵盖稳态淋巴组织：外周淋巴结和肠系膜淋巴结、脾脏、血液、胸腺、派尔集合淋巴结和骨髓。图4涵盖EAE第7天和第15天的淋巴结和脊髓。所有样本均在BD LSRFortessa上使用FACSDiva v8.0.1采集，并保存为FCS 3.0文件。

该数据集包含来自11个独立实验的404个FCS文件，每个实验对应一个zip压缩包。每个压缩包内含样本文件及该实验的单染补偿对照和未染色对照。有关各实验的图面板、采集日期、组织、小鼠基因型与性别以及染色 panel 的信息，请参见README.txt。请注意，在其中一个实验（d15脊髓，实验5）中，采集时有两个通道标签输入错误；README中给出了正确的分配。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。