人类脑脊液蛋白质组深度分析：生物标志物发现与缺失蛋白鉴定的宝贵数据资源

人类脑脊液蛋白质组深度分析：生物标志物发现与缺失蛋白鉴定的宝贵数据资源 [数据集]。主题标签：脑脊液、蛋白质组、生物标志物、缺失蛋白鉴定、神经系统疾病

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蛋白质脑脊液蛋白质组生物标志物缺失蛋白鉴定神经系统疾病

Deep Dive in the Proteome of Human Cerebrospinal Fluid: A Valuable Data Resource for Biomarker Discovery and Missing Protein Identification

基本信息

模态

蛋白质

创建/更新时间

2026-11-04

资源简介

人类脑脊液蛋白质组深度分析：生物标志物发现与缺失蛋白鉴定的宝贵数据资源

该数据集英文名称为“Deep Dive in the Proteome of Human Cerebrospinal Fluid: A Valuable Data Resource for Biomarker Discovery and Missing Protein Identification”，中文可译为“人类脑脊液蛋白质组深度分析：生物标志物发现与缺失蛋白鉴定的宝贵数据资源”。它是一项以人类脑脊液为研究对象的蛋白质组学数据集，主题标签涵盖脑脊液、蛋白质组、生物标志物、缺失蛋白鉴定与神经系统疾病。数据集来源于 eb i.ac.uk 的 PRIDE 归档项目（项目编号 PXD009646），由 Charlotte Macron 于 2018 年发布。从定位上看，该数据集面向神经系统疾病相关研究，旨在为生物标志物发现和缺失蛋白鉴定提供可复用的数据资源，属于神经系统疾病／其他分类下的公开科研数据。

【数据集背景】

脑脊液与中枢神经系统直接接触，其蛋白质组成常被用于反映神经系统生理与病理状态，因此脑脊液蛋白质组研究在神经系统疾病的生物标志物探索中具有重要价值。该数据集以“深度分析”人类脑脊液蛋白质组为目标，强调其作为生物标志物发现与缺失蛋白鉴定数据资源的双重用途。数据集由 Charlotte Macron 于 2018 年发布，归档于 eb i.ac.uk 的 PRIDE 项目 PXD009646，属于蛋白质组学领域的公开数据资源。

【数据内容】

该数据集的主题围绕人类脑脊液蛋白质组展开，标签包括脑脊液、蛋白质组、生物标志物、缺失蛋白鉴定和神经系统疾病。其核心内容定位于脑脊液蛋白质组的深度分析结果，服务于生物标志物发现与缺失蛋白鉴定两类研究需求。除上述主题与用途定位外，源站未提供关于样本数量、蛋白鉴定数量、实验分组、文件类型与数据规模的进一步说明。

【采集与来源】

数据集来源站为 eb i.ac.uk，源站描述标明其为 Charlotte Macron（2018）发布的数据集，归档地址为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009646。该数据集通过 PRIDE 归档项目对外提供。关于样本采集地点、供体信息、伦理审批与具体实验流程，源站未提供。

【适用场景】

依据其主题与定位，该数据集适用于神经系统疾病相关的生物标志物发现研究，以及蛋白质组学中的缺失蛋白鉴定工作；也可作为人类脑脊液蛋白质组深度分析的可复用数据资源，用于方法比较与结果验证等科研用途。具体适用分析类型与配套工具，源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 PRIDE 归档项目 PXD009646 的形式发布，可通过源站给出的项目地址访问。关于数据下载方式、文件组织、检索接口与分析流程，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 2018 年发布的公开归档资源，其质量评估指标、技术验证细节、覆盖度与已知偏差，源站未提供。使用时应注意其主题范围限定于人类脑脊液蛋白质组，其他样本类型与疾病领域的适用性未在源站描述中说明。

【引用与许可】

引用信息可依据源站描述：Charlotte Macron (2018). Deep Dive in the Proteome of Human Cerebrospinal Fluid: A Valuable Data Resource for Biomarker Discovery and Missing Protein Identification [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009646。关于该数据集的许可条款与使用限制，源站未提供。

原始链接

https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009646

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使用方式

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009646

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

夏洛特·马克龙（2018）。《人类脑脊液蛋白质组的深度探索：生物标志物发现与缺失蛋白质鉴定的宝贵数据资源》[数据集]。https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD009646

数据加载示例（图像类）

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import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别