小鼠脑内神经炎症性星形胶质细胞亚型数据集 - PathMap 实验 #000127

数据集聚焦小鼠脑内神经炎症性星形胶质细胞亚型,包含原始 JSON 执行轨迹、逐字验证引文以及由 PathMap Studio 的 Veridical Enforcement 引擎生成的 MeSH 对齐逻辑门

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基因组分类Pathologic Processes_gates_from_pathologic_processesGene Expression Regulation_gates_to_gene_expression_regulation_gates_from_gene_expression_regulationBiological Phenomena_gates_to_biological_phenomena_gates_from_biological_phenomenaNeuroinflammatory Diseases_gates_to_neuroinflammatory_diseasesTraumatic Injury_gates_from_traumatic_injury
Dataset: Neuroinflammatory astrocyte subtypes in the mouse brain - PathMap Experiment #000127

基本信息

模态
基因组
大小
0.001067394 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

小鼠脑内神经炎症性星形胶质细胞亚型数据集 - PathMap 实验 #000127

Dataset: Neuroinflammatory astrocyte subtypes in the mouse brain - PathMap Experiment #000127

该数据集来自 doi.org 来源站,由 Dungan, Joshua 提供,机构为 Zenodo,发布时间为 2026 年。数据集聚焦小鼠脑内神经炎症性星形胶质细胞亚型,包含原始 JSON 执行轨迹、逐字验证引文以及由 PathMap Studio 的 Veridical Enforcement 引擎生成的 MeSH 对齐逻辑门。数据涉及星形胶质细胞活化、星形胶质细胞-小胶质细胞网络以及突触周星形胶质细胞过程等主题,可用于研究神经炎症相关病理过程与基因表达调控(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):交互式数据查看器:从第一天起即可阅读、查看和打印。使用我们的全交互式查看器,从第一天起即可查看、阅读和打印本研究数据: Artificial General Intelligence LLC 评估声明:小鼠脑内神经炎症性星形胶质细胞亚型。该数据集包含由 PathMap Studio 的 Veridical Enforcement 引擎生成的原始 JSON 执行轨迹、逐字验证引文和 MeSH 对齐逻辑门。🔍 新颖且被忽视的见解:星形胶质细胞活化并非 exclusively 一个增殖过程;在周围神经损伤等模型中,脊髓星形胶质细胞主要通过重塑而非细胞分裂作出反应。星形胶质细胞-小胶质细胞网络,而非单个细胞活化,是限制病变和恢复稳态的关键功能单元。突触周星形胶质细胞过程代表独特的

【主题与分类】

主题标签:Pathologic Processes、_gates_from_pathologic_processes、Gene Expression Regulation、_gates_to_gene_expression_regulation、_gates_from_gene_expression_regulation、Biological Phenomena、_gates_to_biological_phenomena、_gates_from_biological_phenomena、Neuroinflammatory Diseases、_gates_to_neuroinflammatory_diseases。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.21986940

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.21986940

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.1 MB。

数据说明

交互式数据查看器:从第一天起即可阅读、查看和打印。使用我们的全交互式查看器,从第一天起即可查看、阅读并打印本研究数据:https://pathmap.org/viewer.php?id=127 Artificial General Intelligence LLC 评估主张:小鼠大脑中的神经炎症性星形胶质细胞亚型。该数据集包含原始JSON执行轨迹、逐字验证的引文,以及由PathMap Studio的Veridical Enforcement引擎生成的与MeSH对齐的逻辑门。🔍 新颖且被忽视的见解。星形胶质细胞激活并非 exclusively 一种增殖过程;在周围神经损伤等模型中,脊髓星形胶质细胞主要通过重塑而非细胞分裂作出反应。星形胶质细胞-小胶质细胞网络,而非单个细胞激活,是限制病变和恢复稳态的关键功能单元。突触周星形胶质细胞突起是局部蛋白质合成的独特“热点”,可能绕过整体细胞转录状态。特定蛋白质(如MINK1和PLEKHB1)的表达为不同脑区星形胶质细胞的功能身份提供了空间坐标系。

脂质代谢(例如长链脂肪酸)和线粒体功能是缺血性损伤中神经毒性星形胶质细胞表型的主要驱动因素。星形胶质细胞激活的“神经毒性”与“神经保护”范式正被这样一种认识所取代:其状态高度依赖于具体情境,无法用简化的范式来解释。由小胶质细胞衍生细胞因子调控的Piezo1机械信号传导,将组织物理改变与星形胶质细胞的炎症特征联系起来。转录异质性:** 创伤性损伤后,星形胶质细胞至少存在五种不同的亚群,其中Osmr+变异体表现出特定的神经毒性和保护性代谢特征。机械感知:** 内皮Piezo1传感器通过cAMP-Epac1微囊泡将机械应力转化为星形胶质细胞凋亡

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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