精神分裂症患者眶额皮质定量亚细胞蛋白质组数据
研究对 12 例精神分裂症患者与 8 例健康对照的眶额皮质进行 iTRAQ 标记与 SRM 定量蛋白质组分析，覆盖线粒体、粗核与细胞质三个亚细胞组分，分别鉴定到 655、1500 和 1591 个蛋白组，并发现 166 个蛋白组在各富集组分中失调
基本信息
资源简介
精神分裂症患者眶额皮质定量亚细胞蛋白质组数据
Quantitative Subcellular
Proteomics of the Orbitofrontal
Cortex of Schizophrenia Patients
该数据集来自 figshare，配套论文发表于 Journal of Proteome Research（2019）。研究对 12 例精神分裂症患者与 8 例健康对照的眶额皮质进行 iTRAQ 标记与 SRM 定量蛋白质组分析，覆盖线粒体、粗核与细胞质三个亚细胞组分，分别鉴定到 655、1500 和 1591 个蛋白组，并发现 166 个蛋白组在各富集组分中失调。数据可用于探索钙与谷氨酸失衡、CREB 激活信号紊乱、轴突导向等通路，支持精神分裂症病理生理机制研究与候选标志物预测（来源 figshare，CC BY-NC 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Quantitative Subcellular Proteomics of the Orbitofrontal Cortex of Schizophrenia Patients》发表于 Journal of Proteome Research（2019），DOI：10.1021/acs.jproteome.9b00398。源站首次发布：2019-10-28。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：精神分裂症是一种慢性疾病，以精神功能受损并伴有明显社会功能障碍为特征。采用 iTRAQ 标记与 SRM 的定量蛋白质组学方法，对线粒体（MIT）、粗核组分（NUC）和细胞质（CYT）进行表征，可观察细胞区室的动态变化，为精神分裂症病理生理学提供有价值的见解。对 12 例精神分裂症患者和 8 例健康对照的眶额皮质进行质谱分析，在 MIT 组分中鉴定到 655 个蛋白组，NUC 中 1500 个，CYT 中 1591 个。我们发现所有富集细胞组分中共有 166 个蛋白组失调。通过定量蛋白质组分析，我们检测到的主要生物学通路包括钙与谷氨酸失衡、CREB 激活的细胞信号传导破坏、轴突导向，以及
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 1.16 MB。数据集 DOI：10.1021/acs.jproteome.9b00398.s003。
【主题与分类】
源站学科分类：Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Neuroscience、Physiology。主题标签：MIT fraction、655 protein groups、ProteomeXchange Repository、cell compartments、complement protein C 3.、proteins dysregulated、proteomic analysis、CREB activation、NF-kB、data analysis。本站分类：精神与行为障碍。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Neuroscience、Physiology。
【获取与许可】
源站页面：https://acs.figshare.com/articles/dataset/Quantitative_Subcellular_Proteomics_of_the_Orbitofrontal_Cortex_of_Schizophrenia_Patients/10060100
使用许可：CC BY-NC 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/）。
规范引用：Velásquez, Erika; Martins-de-Souza, Daniel; Velásquez, Ingrid; Carneiro, Gabriel Reis Alves; Schmitt, Andrea; Falkai, Peter; et al. (2019). Quantitative Subcellular Proteomics of the Orbitofrontal Cortex of Schizophrenia Patients. ACS Publications. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-02，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Quantitative Subcellular
Proteomics of the Orbitofrontal
Cortex of Schizophrenia Patients - DOI：10.1021/acs.jproteome.9b00398.s003
- 发布日期：2019-10-28
- 文件数：1 个
- 文件总体积：1.16 MB
- 源站页面：https://acs.figshare.com/articles/dataset/Quantitative_Subcellular_Proteomics_of_the_Orbitofrontal_Cortex_of_Schizophrenia_Patients/10060100
命令行下载
curl -L -o "pr9b00398_si_003.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/18131375"
文件清单
pr9b00398_si_003.xlsx（1.16 MB）
文件总体积 1.16 MB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
精神分裂症是一种慢性疾病，以精神功能受损并伴有显著的社会功能障碍为特征。采用iTRAQ标记和SRM的定量蛋白质组学方法，对线粒体（MIT）、粗核组分（NUC）和细胞质（CYT）进行表征，可以观察细胞区室的动态变化，为精神分裂症的病理生理学提供有价值的见解。对12名精神分裂症患者和8名健康对照者的眶额皮质进行质谱分析，在MIT组分中鉴定出655个蛋白质组，在NUC中鉴定出1500个，在CYT中鉴定出1591个。我们发现在所有富集的细胞组分中共有166组蛋白质失调。通过定量蛋白质组学分析，我们检测到的主要生物学通路涉及钙和谷氨酸失衡、CREB激活的细胞信号传导中断、轴突导向，以及参与NF-kB信号激活的蛋白质，同时伴有补体蛋白C3的增加。
基于我们的数据分析，我们提出NF-kB的激活可能是连接精神分裂症患者中谷氨酸失调、钙、细胞凋亡以及免疫系统激活的一条可能途径。所有质谱数据均可在ProteomeXchange Repository中获取，标识符为PXD015356和PXD014350。
许可
CC BY-NC 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1021/acs.jproteome.9b00398.s003（source: https://acs.figshare.com/articles/dataset/Quantitative_Subcellular_Proteomics_of_the_Orbitofrontal_Cortex_of_Schizophrenia_Patients/10060100）。
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