雄性与雌性大鼠脑内长型芳香化酶mRNA定量分析数据
体外研究表明,雌激素在两性中均能急性调节突触功能。这些急性效应在体内可能由脑内合成的雌激素介导,而脑内雌激素的波动可能比循环雌激素更快

基本信息
资源简介
雄性与雌性大鼠脑内长型芳香化酶mRNA定量分析数据
该数据集英文名为“Data from: Quantitative analysis of long-form aromatase mRNA in the male and female rat brain”,由Tabatadze, Nino、Sato, Satoru M.与Woolley, Catherine S.共同完成,机构为Dryad,发布时间为2015年,采用Creative Commons Zero v1.0 Universal许可。数据集关注雄性与雌性大鼠脑内长型芳香化酶mRNA的定量分析,属于神经系统疾病/其他分类,来源站为doi.org。源站描述指出,体外研究表明雌激素在两性中均能急性调节突触功能,这些急性效应在体内可能由脑内合成的雌激素介导,而脑内雌激素的波动可能比循环雌激素更快。为验证这一点,研究者需要确认能够急性响应雌激素的脑区具备合成雌激素的能力。该数据集正是围绕这一问题,利用定量实时PCR技术,测量雄性和雌性大鼠不同脑区中芳香化酶mRNA的表达情况,并特别针对仅存在于长型芳香化酶中的序列进行检测,以区分具有芳香化酶活性的长型与功能未知的短型。整体而言,该数据集为探索脑内雌激素局部合成机制及其在突触功能调节中的潜在作用提供了分子表达层面的实验数据基础。
【数据集背景】
源站描述显示,体外研究已表明雌激素在两性中均能急性调节突触功能。这些急性效应在体内可能由脑内合成的雌激素介导,而脑内雌激素的波动可能比循环雌激素更快。若这一假设成立,那么能够急性响应雌激素的脑区应当具备合成雌激素的能力。为探究该问题,研究者聚焦于雌激素合成酶——芳香化酶。由于脑内芳香化酶存在两种形式:一种是有芳香化酶活性的长型,另一种是功能未知的短型,因此研究者选择靶向仅存在于长型芳香化酶中的序列,以更准确地反映具有活性的芳香化酶mRNA表达。该数据集即产生于这一研究背景,旨在通过定量实时PCR方法,在雄性和雌性大鼠的不同脑区中测量长型芳香化酶mRNA的表达水平。
【数据内容】
该数据集的核心内容为雄性和雌性大鼠不同脑区中长型芳香化酶mRNA的定量实时PCR测量结果。源站描述提到,采用靶向长型芳香化酶特有序列的方法后,研究者发现芳香化酶mRNA在杏仁核中表达最高,紧随其后的是终纹床核(BNST)和pr——源站描述在此处截断,未提供完整信息。因此,关于“pr”所指的具体脑区以及其余脑区的表达情况,源站未提供。数据集可能包含不同脑区、不同性别之间的表达比较数据,但具体样本数量、脑区完整列表、表达数值、统计结果等内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为doi.org,机构为Dryad,发布时间为2015年。作者为Tabatadze, Nino、Sato, Satoru M.与Woolley, Catherine S.。源站描述说明,研究使用定量实时PCR测量雄性和雌性大鼠不同脑区中芳香化酶mRNA的表达,并靶向长型芳香化酶独有的序列。关于大鼠的品系、年龄、性别分组数量、饲养条件、脑区取材方法、RNA提取与逆转录方案、PCR引物序列、内参基因、实验重复次数等具体采集细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于关注脑内雌激素合成、芳香化酶表达调控以及性别差异的研究场景。由于源站描述强调雌激素可能通过脑内局部合成来急性调节突触功能,并且脑内雌激素波动可能快于循环雌激素,因此该数据集可用于支持或检验与脑区特异性芳香化酶表达相关的假设。具体而言,它可能适用于神经内分泌学、行为神经科学、突触可塑性以及神经系统疾病相关研究中的背景数据或比较数据。然而,由于源站描述仅提及杏仁核、终纹床核(BNST)和“pr”的部分信息,且未提供完整脑区列表和定量结果,因此该数据集在具体应用时需结合原始研究文献或完整数据文件进行判断。任何超出源站描述的具体适用结论,源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过来源站doi.org获取,机构为Dryad,采用Creative Commons Zero v1.0 Universal许可。使用者可依据该许可条款使用、共享和修改数据。由于源站描述未提供数据文件的具体格式、组织结构、变量命名、缺失值编码或分析脚本,因此关于如何读取、合并、标准化或统计处理这些数据的具体步骤,源站未提供。建议使用者参考原始论文或Dryad数据页面中的说明文件,以了解定量实时PCR数据的详细结构。若需复现源站描述中提到的芳香化酶mRNA表达比较,使用者应关注长型芳香化酶特异性序列的检测方法,并注意区分长型与短型芳香化酶。具体操作层面的指导,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于定量实时PCR方法,靶向长型芳香化酶特有序列,这有助于提高检测长型芳香化酶mRNA的特异性。源站描述提到,研究者发现杏仁核中表达最高,终纹床核(BNST)紧随其后,但描述在“pr”处截断,因此无法获知完整结果。该数据集的限制包括:源站描述未提供样本量、性别分组细节、脑区完整列表、表达定量数值、统计检验方法、内参选择、引物验证信息以及实验重复情况。此外,源站描述仅涉及雄性和雌性大鼠,未提及其他物种。由于描述截断,关于“pr”脑区的具体名称和结果,源站未提供。使用者应注意,该数据集仅反映长型芳香化酶mRNA的表达,不能直接等同于芳香化酶蛋白活性或雌激素合成速率。其他质量评估信息,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的英文名称为“Data from: Quantitative analysis of long-form aromatase mRNA in the male and female rat brain”,作者为Tabatadze, Nino、Sato, Satoru M.与Woolley, Catherine S.,机构为Dryad,发布时间为2015年,来源站为doi.org。许可方式为Creative Commons Zero v1.0 Universal。引用时应依据该数据集在来源站上的正式引用信息进行标注。关于具体的引用格式、DOI链接、版本信息以及Dryad推荐引用文本,源站未提供。使用者应遵守Creative Commons Zero v1.0 Universal许可条款,该许可通常允许无条件使用、共享和修改数据,但具体法律含义以许可原文为准。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.pr1jf
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 175.4 KB。
数据说明
体外研究显示,雌激素在两性中均能急性调节突触功能。这些急性效应在体内可能由脑内合成的雌激素介导,其水平可能比循环中的雌激素波动得更快。若果真如此,那些对雌激素产生急性反应的脑区应具备合成雌激素的能力。为探究这一问题,我们采用定量实时PCR技术,检测了雄性和雌性大鼠不同脑区中雌激素合成酶——芳香化酶mRNA的表达情况。重要的是,由于脑内芳香化酶存在两种形式:具有芳香化酶活性的长型及功能未知的短型,我们针对仅存在于长型芳香化酶中的序列进行了检测。通过这种方法,我们发现芳香化酶mRNA在杏仁核中的表达最高,紧随其后的是终纹床核(BNST)和视前区(POA);在海马背侧和扣带回皮层中检测到中等水平的芳香化酶mRNA;而在脑干和小脑中虽可检测到芳香化酶mRNA,但水平极低。
在杏仁核中,性腺/激素状态对雌雄两性的芳香化酶表达均有调节作用;在BNST和POA中,雄性去势下调了芳香化酶,而雌二醇对去卵巢雌性没有影响。在背侧海马和扣带皮层中,雄性与雌性之间的芳香化酶水平没有差异,性腺/激素状态也没有影响。这些发现表明,长型芳香化酶表达于对雌激素有急性反应的大脑区域,如背侧海马,并且芳香化酶的性腺/激素调节在不同脑区之间存在差异。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




