DIPG中组蛋白H3.3 K27M染色质功能涉及ASCL1和NEUROD1等神经发育因子网络的数据

源站描述显示,研究比较了毛细胞型星形细胞瘤(PA)与H3K27变异型弥漫性中线胶质瘤(DMG)的DSC磁共振成像参数和ADC,涉及23例中线PA患者和40例DMG患者(含35例H3.3突变和5例H3.1突变),治疗时间为2016年1月至2022年5月

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2023-07-14 更新
浏览 7
时间序列分类dynamic susceptibility contrastdiffuse midline gliomanormalized mean adcapparent diffusion coefficient1 &# 8211significantly lower nadcmeanxlink "> dmgaltered </ pxlink ">p </midline paslower nadcmean
Data from: Histone H3.3 K27M chromatin functions implicate a network of neurodevelopmental factors including ASCL1 and NEUROD1 in DIPG

基本信息

模态
时间序列
大小
0.000009728 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-07-14
版本
v1

资源简介

DIPG中组蛋白H3.3 K27M染色质功能涉及ASCL1和NEUROD1等神经发育因子网络的数据

Demographic and imaging data.

该数据集来自plos.figshare.com,标题为“Demographic and imaging data.”,包含1个文件(Table 1.xls),由Ryo Kurokawa等作者于2023年7月14日发布。源站描述显示,研究比较了毛细胞型星形细胞瘤(PA)与H3K27变异型弥漫性中线胶质瘤(DMG)的DSC磁共振成像参数和ADC,涉及23例中线PA患者和40例DMG患者(含35例H3.3突变和5例H3.1突变),治疗时间为2016年1月至2022年5月。数据可用于分析nrCBV、nrCBF、PSR和nADCmean等影像指标在两组间的差异(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2023-07-14。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的 本研究比较了毛细胞型星形细胞瘤(PA)与H3K27变异型弥漫性中线胶质瘤(DMG)之间的动态磁敏感对比(DSC)磁共振成像参数和表观扩散系数(ADC)。方法 对23例中线PA患者(中位年龄13岁[范围1-71岁];13例女性)和40例DMG患者(8.5岁[1-35岁];19例女性),包括35例H3.3突变和5例H3.1突变肿瘤患者,在2016年1月至2022年5月期间接受治疗,比较其归一化相对脑血容量(nrCBV)、归一化相对血流量(nrCBF)、百分位信号恢复(PSR)和归一化平均ADC(nADCmean)。结果 DMG的nADCmean显著较低(中位数:1.48 vs. 1.96;p = 0.00075),PSR较低(0.97 vs. 1.23,p = 0.13),但nrCBV和nrCBF较高(1.66 vs. 1.17,p = 0.058,

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 9.73 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0288412.t001。

【主题与分类】

源站学科分类:Medicine、Cell Biology、Developmental Biology、Cancer、Infectious Diseases。主题标签:dynamic susceptibility contrast、diffuse midline glioma、normalized mean adc、apparent diffusion coefficient、1 &# 8211、significantly lower nadcmean、midline pas、lower nadcmean、lower adc、study compared。本站分类:神经系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medicine、Cell Biology、Developmental Biology、Cancer、Infectious Diseases。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Demographic_and_imaging_data_/23687735

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Kurokawa, Ryo; Kurokawa, Mariko; Baba, Akira; Kim, John; Srinivasan, Ashok; Moritani, Toshio (2023). Demographic and imaging data.. PLOS ONE. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table 1.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/41567360"

文件清单

  • Table 1.xls(9.73 KB)

文件总体积 9.73 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

目的
本研究比较了毛细胞型星形细胞瘤(PA)与H3K27变异型弥漫性中线胶质瘤(DMG)的动态磁敏感对比(DSC)磁共振成像参数及表观扩散系数(ADC)。方法
对2016年1月至2022年5月期间接受治疗的23例中线PA患者(中位年龄13岁[范围1–71岁];女性13例)和40例DMG患者(8.5岁[1–35岁];女性19例),包括35例H3.3突变型和5例H3.1突变型肿瘤患者,其标准化相对脑血容量(nrCBV)、标准化相对血流量(nrCBF)、百分位信号恢复率(PSR)及标准化平均ADC(nADCmean)进行统计学比较。结果
与PA相比,DMG的nADCmean显著较低(中位数:1.48 vs. 1.96;p = 0.00075),PSR较低(0.97 vs. 1.23,p = 0.13),但nrCBV和nrCBF较高(分别为1.66 vs. 1.17,p = 0.058;1.87 vs. 1.19,p = 0.028)。H3.3变异型的nADCmean低于H3.1变异型(1.46 vs. 1.80,p = 0.10)。结论
与PA相比,DMG具有较低的ADC和PSR以及较高的rCBV和rCBF。H3.3变异型的ADC低于H3.1变异型。

识别这些肿瘤在DSC参数和ADC方面的异同,可能有助于术前诊断。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0288412.t001(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Demographic_and_imaging_data_/23687735)。

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