小鼠全脑恐惧记忆网络的化学遗传学解析数据

该数据集来自 Dryad,对应一项关于小鼠全脑恐惧记忆网络的研究。研究基于 c-fos 表达映射识别出被恐惧记忆共同激活的脑区网络,并通过在计算机模拟节点删除,发现移除高度连接节点对网络全局效率的破坏最大

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浏览 17
基因组分类CA1functional connectivityHippocampuschemogeneticsreuniens thalamic nucleusNeocortexcontextual fear conditioninglateral septal nucleuslaterodorsal thalamic nucleus
Data from: Chemogenetic interrogation of a brain-wide fear memory network in mice

基本信息

模态
基因组
大小
0.000396848 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

小鼠全脑恐惧记忆网络的化学遗传学解析数据

Data from: Chemogenetic interrogation of a brain-wide fear memory network in mice

该数据集来自 Dryad,对应一项关于小鼠全脑恐惧记忆网络的研究。研究基于 c-fos 表达映射识别出被恐惧记忆共同激活的脑区网络,并通过在计算机模拟节点删除,发现移除高度连接节点对网络全局效率的破坏最大。随后通过训练后化学遗传学沉默不同网络节点,检验其对恐惧记忆巩固的影响。数据涵盖 CA1、Hippocampus、reuniens thalamic nucleus、Neocortex、lateral septal nucleus、laterodorsal thalamic nucleus 等区域,可用于研究功能连接、hub 节点与行为输出之间的关系(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Univ。

【数据集背景】

源站首次发布:2018。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):行为依赖于多个脑区之间的协调活动。在此类网络中,假定高度连接的 hub 脑区对行为输出具有不成比例的影响,尽管这一假设尚未被系统评估。此前,通过绘制活动调节基因 c-fos 的全脑表达,我们识别出一个由恐惧记忆共同激活的脑区网络。为了检验 hub 脑区对网络功能更重要的假设,在此,我们在该行为定义的功能网络中于计算机模拟节点删除。移除高度节点产生了最大的网络破坏(例如全局效率降低)。为了在体内检验这些预测,我们检查了训练后化学遗传学沉默不同网络节点对恐惧记忆巩固的影响。在一系列独立实验中,涵盖 25% 的

【主题与分类】

主题标签:CA1、functional connectivity、Hippocampus、chemogenetics、reuniens thalamic nucleus、Neocortex、contextual fear conditioning、lateral septal nucleus、laterodorsal thalamic nucleus。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.86337

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 396.8 KB。

数据说明

行为依赖于多个脑区之间的协同活动。在此类网络中,高度连接的枢纽脑区被认为对行为输出具有不成比例的影响,尽管这一假设尚未得到系统评估。此前,通过绘制活动调节基因c-fos在全脑范围内的表达,我们鉴定出一个由恐惧记忆共同激活的脑区网络。为了检验枢纽脑区对网络功能更为重要这一假设,在此,我们在这一行为定义的功能网络中进行了计算机模拟的节点删除。移除高度节点产生了最大的网络破坏(例如,全局效率的降低)。为了在体内检验这些预测,我们考察了训练后化学遗传学沉默不同网络节点对恐惧记忆巩固的影响。在一系列独立实验中,涵盖了25%的网络节点(即84个脑区中的21个),我们发现节点度能够准确预测所观察到的记忆巩固缺陷,沉默高度连接的枢纽产生了最大的损害。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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