PXD001135:衰老系列中小鼠海马突触体的相对蛋白质定量

年老野生型小鼠出现海马依赖性空间记忆损伤。检测20至100周龄小鼠海马突触蛋白质组发现,细胞外基质蛋白是唯一随时间进行性上调的蛋白群;免疫印迹和组织化学证实其增多可能限制突触可塑性,可能致年龄相关认知衰退

pride
2014-09-10 更新
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蛋白质回归Natural agingMouseItraqHippocampusSynaptosome
PXD001135: Relative protein quantification in mouse hippocampal synaptosomes during aging series

基本信息

模态
蛋白质
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创建/更新时间
2014-09-10

资源简介

PXD001135:衰老系列中小鼠海马突触体的相对蛋白质定量

年老野生型小鼠出现海马依赖性空间记忆损伤。检测20至100周龄小鼠海马突触蛋白质组发现,细胞外基质蛋白是唯一随时间进行性上调的蛋白群;免疫印迹和组织化学证实其增多可能限制突触可塑性,可能致年龄相关认知衰退。突触蛋白表达随年龄更随机,神经退行性疾病相关蛋白尤甚,基础突触传递相关蛋白变异较低。这些变化和表达变异增加与衰老相关,或致老年突触可塑性降低和认知受损(来源 ebi.ac.uk)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):年龄相关的认知衰退是我们老龄化社会中一个严重的健康问题。在健康脑衰老过程中观察到的认知功能下降,最可能由脑连接性改变和特定脑区的突触功能障碍引起。我们在此表明,衰老的C57BL/6J野生型小鼠存在海马依赖的空间记忆损害。为确定与这些记忆缺陷相关的分子机制,我们研究了小鼠海马突触蛋白质组在20、40、50、60、70、80、90和100周龄时变化的时间进程。细胞外基质蛋白是唯一一组随时间表现出显著且进行性上调的蛋白。免疫印迹和组织化学分析证实了这一点,表明海马细胞外基质水平升高可能限制突触可塑性,是年龄相关认知衰退的潜在原因。此外,我们观察到突触蛋白表达的随机性随年龄增长而增加,尤其是那些先前与多种神经退行性疾病相关联的蛋白,而对于在神经元功能和突触神经传递中发挥基础作用的蛋白,则观察到其表达变异较低。总之,我们的研究结果表明,突触蛋白表达的特异性变化和变异增加都与衰老相关,并可能构成老年时突触可塑性降低和认知表现受损的基础。

【主题与分类】

主题标签:Natural aging、Mouse、Itraq、Hippocampus、Synaptosome。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD001135

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

年龄相关的认知衰退是我们老龄化社会中一个严重的健康问题。在健康脑衰老过程中观察到的认知功能下降,最可能由脑连接性改变和特定脑区的突触功能障碍引起。我们在此表明,衰老的C57BL/6J野生型小鼠存在海马依赖的空间记忆损害。为确定与这些记忆缺陷相关的分子机制,我们研究了小鼠海马突触蛋白质组在20、40、50、60、70、80、90和100周龄时变化的时间进程。细胞外基质蛋白是唯一一组随时间表现出显著且进行性上调的蛋白。免疫印迹和组织化学分析证实了这一点,表明海马细胞外基质水平升高可能限制突触可塑性,是年龄相关认知衰退的潜在原因。此外,我们观察到突触蛋白表达的随机性随年龄增长而增加,尤其是那些先前与多种神经退行性疾病相关联的蛋白,而对于在神经元功能和突触神经传递中发挥基础作用的蛋白,则观察到其表达变异较低。总之,我们的研究结果表明,突触蛋白表达的特异性变化和变异增加都与衰老相关,并可能构成老年时突触可塑性降低和认知表现受损的基础。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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