DANDI 工作坊 DJD

它的名称是 dandi workshop djd,分类为神经系统疾病 / 其他。关于项目发起原因、研究团队、所属课题、资助编号、时间跨度、发布历史等更具体的背景信息,源站未提供

dandi
2021-11-01 更新
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时间序列NWB格式神经电生理神经系统疾病脑科学开放数据数据共享神经数据分析电生理记录
dandi workshop djd

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2021-11-01
版本
draft

资源简介

DANDI 工作坊 DJD

dandi workshop djd 是登记在 dandiarchive.org 上的一个 DANDI Archive 数据集,对应 Dandiset 000155,归入神经系统疾病 / 其他方向,采用 NWB 标准组织神经生理学数据,并与 BRAIN Initiative 相关,联系人信息为 denman, daniel。

【数据集背景】

该数据集的公开来源是 dandiarchive.org,属于 DANDI Archive 中的 Dandiset 000155。它的名称是 dandi workshop djd,分类为神经系统疾病 / 其他。公开说明提到它是 NWB-standard neurophysiology dataset,并带有 BRAIN Initiative 背景,联系人为 denman, daniel。关于项目发起原因、研究团队、所属课题、资助编号、时间跨度、发布历史等更具体的背景信息,源站未提供。

【数据内容】

根据现有说明,该数据集的内容是神经生理学数据,并采用 NWB 标准。它在分类上属于神经系统疾病 / 其他。NWB 是一种常用于神经生理学数据组织与交换的标准格式,其目标是让电生理、行为、光遗传或其他相关信号能够以结构化方式保存。但该数据集具体包含哪些信号类型、通道数量、记录时长、受试者数量、物种、脑区、行为任务、实验条件、疾病模型或健康对照等信息,源站未提供。因此,无法从现有信息判断其内部具体有多少文件、多少会话、多少观测记录,也无法确认是否包含原始数据、处理后的数据或派生数据。关于具体细胞类型、电极阵列、采样率、刺激参数、行为事件、注释标签和元数据字段的说明,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 dandiarchive.org,标识为 Dandiset 000155,名称为 dandi workshop djd。公开说明将其称为 NWB 标准神经生理学数据集,并提到 BRAIN Initiative。联系人写为 denman, daniel。除此之外,采集地点、采集单位、研究者团队、实验设备、记录技术、手术与伦理审批、样本来源、数据生成流程、数据整理流程以及从原始记录到 NWB 文件的转换步骤,源站均未提供。因此,无法确认数据是在何种实验条件下获得,也无法确认是否经过人工审核、自动质控或标准化注释。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集被归入神经系统疾病 / 其他,并采用 NWB 标准保存神经生理学数据,因此其一般定位与神经科学数据共享、神经生理信号分析或相关方法教学有关。但具体适用场景,例如是否适合疾病机制研究、电生理分析、算法基准测试、跨数据集整合、教学演示或可重复性验证,源站未提供。没有足够信息判断它适合哪些物种、哪些脑区、哪些疾病模型或哪些分析任务。任何针对具体研究问题的适用性结论都需要源站提供进一步说明。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括下载方式、访问入口、目录结构、文件命名规则、读取代码、依赖工具、版本控制方式、示例脚本、教程、云访问方式或本地缓存要求。作为通用背景,NWB 标准数据通常可由支持该标准的工具进行读取和探索,但这不构成对该数据集具体使用步骤的说明。该数据集是否附带文档、是否提供 API、是否需要申请访问、是否可直接下载,源站未提供。用户若要使用,应以 dandiarchive.org 上对应 Dandiset 000155 的页面说明为准。

【质量与限制】

关于该数据集的质量信息,例如完整性、一致性、信号质量、缺失值、伪迹、标注可靠性、版本更新、勘误记录、同行评审情况或质量控制流程,源站未提供。其限制条件,例如样本量限制、物种限制、伦理限制、再分发限制、隐私限制、计算资源要求或格式兼容性问题,源站也未提供。由于这些关键信息缺失,无法对数据集的可靠性、可复用性和适用范围作出具体判断。使用者应自行查看源站页面和联系 denman, daniel 获取进一步说明。

【引用与许可】

该数据集的许可条款、使用协议、引用格式、DOI、版本号、发布者、贡献者列表和致谢要求,源站未提供。公开说明只给出联系人 denman, daniel。若需要引用或再分发,应先查看 dandiarchive.org 上 Dandiset 000155 的官方页面,并以该页面列出的许可与引用要求为准。由于许可信息缺失,不能假定该数据集可以无条件用于商业、临床、再发布或衍生作品。

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下载信息

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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

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免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/000155

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 000155。NWB标准的神经生理学数据集(BRAIN Initiative)。联系人:denman, daniel。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。