细胞构筑驱动的非人灵长类海马MRI图谱:衰老过程中亚区体积的保留
基于5只年轻和5只老年恒河猴的组织学重建,右半球海马亚区的概率图谱。主题标签:神经系统疾病、海马亚区、MRI图谱、非人灵长类、衰老、概率图谱、组织学重建

基本信息
资源简介
细胞构筑驱动的非人灵长类海马MRI图谱:衰老过程中亚区体积的保留
该数据集为一份面向非人灵长类海马结构的磁共振成像图谱资源,英文名称为“Cytoarchitectonically-driven MRI atlas of nonhuman primate hippocampus: Preservation of subfield volumes in aging”。其核心内容是基于组织学重建方法构建的右半球海马亚区概率图谱,样本来自5只年轻和5只老年恒河猴。该资源在分类上归属于神经系统疾病相关方向,来源站为neurovault.org。整体而言,该数据集将组织学信息与MRI空间框架相结合,用于刻画恒河猴海马亚区的概率分布,并围绕衰老过程中亚区体积是否得以保留这一主题提供图谱支持。其主题标签涵盖神经系统疾病、海马亚区、MRI图谱、非人灵长类、衰老、概率图谱和组织学重建,适合关注海马精细分割、非人灵长类神经影像及衰老研究的用户参考使用。
【数据集背景】
海马是学习记忆和情绪调控等神经功能的关键结构,其内部可进一步划分为多个亚区。不同亚区在细胞构筑、连接模式和功能角色上存在差异,因此在活体MRI中实现亚区水平的准确识别,对基础神经科学和神经系统疾病研究均具有重要意义。非人灵长类在解剖和认知特征上与人类较为接近,恒河猴因而常被用于衰老及神经退行性过程的比较研究。该数据集以组织学重建为驱动,构建右半球海马亚区的概率图谱,旨在为恒河猴海马亚区的MRI定位与体积分析提供参考框架。其名称中“Preservation of subfield volumes in aging”提示该资源与衰老背景下海马亚区体积保留问题相关,但具体结论性指标源站未提供。
【数据内容】
该数据集提供的是右半球海马亚区的概率图谱。所谓概率图谱,通常以体素或空间位置为单位,表达某一结构或亚区在群体中出现的概率或归属可能性,从而支持在个体MRI中进行亚区划分和体积估计。该图谱基于组织学重建获得,意味着亚区边界和组织构筑信息来自组织学资料,而非仅依赖活体MRI对比度推断。样本由5只年轻和5只老年恒河猴组成,覆盖两个年龄组,为比较衰老相关变化提供基础。关于图谱的具体亚区名称、概率值范围、空间分辨率、文件格式及配套标注文件等信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为neurovault.org。其构建依据为组织学重建,样本为5只年轻和5只老年恒河猴,目标是形成右半球海马亚区的概率图谱。源站描述仅说明该图谱基于这些动物的组织学重建,未提供扫描设备、场强、序列参数、组织学染色方法、切片厚度、配准流程或重建算法等细节。因此,关于采集与来源的更多技术信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于非人灵长类海马亚区相关的MRI研究场景,例如在恒河猴脑影像中辅助定义右半球海马亚区边界、开展亚区体积测量,或为衰老研究中的海马亚区比较提供图谱参考。由于其主题涉及神经系统疾病、海马亚区、非人灵长类、衰老、概率图谱和组织学重建,也可能适用于方法学比较、图谱验证及跨研究配准等任务。但具体适用条件、推荐应用范围及验证结果,源站未提供。
【使用方法】
该数据集为概率图谱资源,通常可在神经影像分析流程中作为参考空间或先验信息使用,例如将个体MRI配准到图谱空间后,依据概率分布进行亚区分割或体积提取。由于该图谱针对右半球海马亚区,使用时需注意半球对应关系。关于具体使用步骤、推荐软件、配准参数、阈值选择及是否提供配套脚本或模板等信息,源站未提供。
【质量与限制】
该图谱基于5只年轻和5只老年恒河猴的组织学重建,样本量较小,且仅覆盖右半球海马亚区。其概率图谱性质意味着结果反映的是样本群体中的分布趋势,而非单个个体的绝对边界。由于源站未提供分辨率、配准误差、组织学与MRI对应精度、年龄分组的具体定义及验证指标,无法进一步评估其精度和泛化能力。相关质量评估信息及使用限制的详细说明,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于neurovault.org。关于引用格式、作者列表、发表文献、DOI、许可证类型及使用条款等信息,源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://neurovault.org/collections/4083
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Probabilistic atlas of rt. hemisphere hippocampal subregions based on histological reconstructions from 5 young and 5 old rhesus macaques.
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




