CynoBrain 猕猴脑图谱

CynoBrain 是基于 9.4 Tesla MRI 群体平均数据构建的高分辨率多模态脑图谱,具备 150 µm 各向同性分辨率,并采样于 75 µm 各向同性模板网格

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医学影像图像分割BiologyMedicinePhotographyHuman anatomyNeurobiologyCynoBrainbrain atlasMRI
CynoBrain Atlas

基本信息

模态
医学影像
任务类型
图像分割
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

CynoBrain 猕猴脑图谱

CynoBrain Atlas

CynoBrain 是基于 9.4 Tesla MRI 群体平均数据构建的高分辨率多模态脑图谱,具备 150 µm 各向同性分辨率,并采样于 75 µm 各向同性模板网格。该图谱包含共配准的全脑自发荧光模板,可分辨 MRI 模板中不可见的细胞构筑边界,并整合 D99 143 区、M132 105 区及 SARM 三种分区方案。基于空间转录组学定义的皮层分层从 2D 切片重建至体积公共空间,提供覆盖全皮层的六层分割。该数据可用于脑区划分、皮层分层分析及多模态脑图谱研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):CynoBrain 被呈现为一个高分辨率多模态脑图谱,由在 9.4 Tesla 下采集的群体平均 MRI 数据构建,具有 150 µm 各向同性分辨率,并采样于 75 µm 各向同性模板网格。一个共配准的全脑自发荧光模板可分辨 MRI 模板中不可见的细胞构筑边界。三种主要分区方案,D99 143 区、M132 105 区和 SARM,被纳入 CynoBrain 空间。基于空间转录组学的皮层分层定义,从 2D 切片重建至体积公共空间,提供了覆盖全皮层的六层皮层分割。

【主题与分类】

主题标签:Biology、Medicine、Photography、Human anatomy、Neurobiology、CynoBrain、brain atlas、MRI。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=21a5d34879af49138646c3946454aaa1

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

CynoBrain 是一个高分辨率多模态脑图谱,基于在 9.4 Tesla 下采集、具有 150 µm 各向同性分辨率的人群平均 MRI 数据构建,并在 75 µm 各向同性模板网格上采样。一个共配准的全脑自发荧光模板可解析 MRI 模板中不可见的细胞构筑边界。CynoBrain 空间中整合了三种主要分区方案:D99 143 区、M132 105 区和 SARM。基于空间转录组学的分层定义由 2D 切片重建至体积共同空间,提供了覆盖整个皮层的六层皮层分割。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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