不同频率正弦波电刺激下神经元动作电位触发特征数据集_part3

主题标签:神经系统疾病、神经生理学、动作电位、正弦波电刺激、DANDI Archive、NWB标准、BRAIN Initiative

dandi
2024-05-21 更新
浏览 8
时间序列分类神经系统疾病神经生理学动作电位正弦波电刺激DANDI ArchiveNWB标准BRAIN Initiative
Characterization of Neuron Action Potential Triggering Using Sine Wave Electrostimulation at Varying Frequencies_part3

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2024-05-21
版本
0.240527.1431

资源简介

不同频率正弦波电刺激下神经元动作电位触发特征数据集_part3

该数据集名为 Characterization of Neuron Action Potential Triggering Using Sine Wave Electrostimulation at Varying Frequencies_part3,收录于 DANDI Archive,对应 dandiset 编号 001034,属于神经生理学领域的 NWB 标准数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。数据集围绕神经系统疾病与神经生理学主题,关注动作电位在正弦波电刺激条件下的触发特征,且刺激频率被设置为不同取值。数据来源站为 dandiarchive.org,联系人为 Silkuniene, Giedre。整体而言,该数据集面向神经电生理研究场景,提供符合 NWB 标准的神经生理学数据资源,便于研究者围绕电刺激参数与神经元动作电位触发之间的关系开展分析、复用与比较研究。

【数据集背景】

该数据集的主题标签包括神经系统疾病、神经生理学、动作电位、正弦波电刺激、DANDI Archive、NWB 标准以及 BRAIN Initiative。其研究背景涉及神经系统中动作电位的触发机制,并采用正弦波电刺激作为干预或刺激方式,同时考察不同频率条件下的影响。数据集被归类为神经系统疾病 / 其他,说明其与神经系统疾病研究方向存在关联,但具体疾病对象、实验模型或临床背景未在已知信息中展开。源站描述指出该数据集属于 DANDI Archive 的 dandiset 001034,并采用 NWB 标准,且与 BRAIN Initiative 相关。联系人信息为 Silkuniene, Giedre。除上述内容外,关于该数据集的具体研究假设、实验目的、项目背景和资助信息,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的核心内容围绕神经元动作电位触发与正弦波电刺激之间的关系展开,尤其关注在不同频率条件下动作电位触发的表征。主题标签明确包含动作电位、正弦波电刺激和神经生理学,表明数据内容属于神经电生理信号及相关刺激记录范畴。数据集采用 NWB 标准,说明其数据组织遵循神经生理学数据常见的标准化格式。数据集名称中包含“part3”,提示其可能为系列数据的一部分,但系列整体结构、前后部分关系以及本部分的具体划分方式,源站未提供。关于数据的具体模态、通道数量、采样率、记录时长、受试对象类型、刺激参数范围、动作电位检测方法、文件数量与数据规模等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 中的 dandiset 001034。源站描述将其标注为 NWB-standard neurophysiology dataset,并注明与 BRAIN Initiative 相关。联系人信息为 Silkuniene, Giedre。数据集的英文名称表明其内容涉及使用不同频率的正弦波电刺激来表征神经元动作电位触发。除来源站、编号、标准、项目关联和联系人之外,关于采集设备、实验地点、动物或人类受试者信息、伦理审批、刺激电极配置、记录电极类型、实验流程和采集时间等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

基于已知信息,该数据集适用于神经生理学相关研究,尤其是围绕动作电位触发机制、正弦波电刺激以及不同刺激频率影响的探索性分析。其主题标签包含神经系统疾病,因此也可能服务于神经系统疾病方向的基础研究或方法学研究。由于数据采用 NWB 标准并发布于 DANDI Archive,该数据集适合用于标准化神经生理学数据的复用、比较、方法验证以及再分析。数据集名称中的“part3”提示其可能适合与同一系列的其他部分联合使用,但具体联合方式与适用范围,源站未提供。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物筛选、器械开发或特定疾病模型验证等场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 NWB 标准组织,并发布于 DANDI Archive,通常可通过 DANDI Archive 平台进行访问、检索和下载。使用者可依据 NWB 标准工具链读取和处理数据,围绕正弦波电刺激频率与动作电位触发之间的关系开展分析。由于数据集名称包含“part3”,使用时应关注其与同系列其他部分的关系,但具体组织方式、文件命名规则、下载路径、访问权限、推荐软件版本和分析流程,源站未提供。关于是否需要进行预处理、如何识别动作电位、如何对齐刺激与记录、如何统计触发特征等操作细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集采用 NWB 标准,并收录于 DANDI Archive,且与 BRAIN Initiative 相关,这些信息表明其在数据组织与发布层面具有标准化背景。联系人信息为 Silkuniene, Giedre,可作为数据相关沟通的参考。然而,关于数据质量指标、缺失值情况、噪声水平、动作电位标注可靠性、刺激伪迹处理、样本量、重复次数、批次效应、跨实验室一致性以及潜在偏差等信息,源站未提供。数据集名称中的“part3”也可能意味着其并非完整数据集,使用时应留意部分与整体的关系,但具体限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 001034,联系人信息为 Silkuniene, Giedre。关于该数据集的正式引用格式、作者列表、版本号、DOI、发布日期、更新历史、许可证类型、使用条款、商业使用限制、再分发要求以及署名要求等信息,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应依据 DANDI Archive 页面或相关发布信息核实具体引用与许可要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001034

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001034. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Silkuniene, Giedre.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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