第90天C9ORF72-ALS/FTD脑类器官单细胞水平特征数据集
该数据集来源于omicsdi.org,基于C9ORF72六核苷酸重复扩增(HRE)相关的肌萎缩侧索硬化(ALS)与额颞叶痴呆(FTD)患者及对照的脑类器官模型,构建了第90天的单细胞RNA测序数据

基本信息
资源简介
第90天C9ORF72-ALS/FTD脑类器官单细胞水平特征数据集
该数据集聚焦于C9ORF72基因六核苷酸重复扩增(HRE)相关的肌萎缩侧索硬化(ALS)与额颞叶痴呆(FTD),利用来源于患者及对照的脑类器官模型,在第90天开展单细胞水平的转录组刻画。C9ORF72的HRE是ALS和FTD最常见的遗传病因,而人脑影像与实验研究提示C9-ALS/FTD在疾病早期即已出现改变,这些早期变化目前仍认识有限。该数据集以单细胞RNA测序为手段,旨在捕捉类器官在发育至第90天时的细胞状态与表达特征,为理解疾病起始阶段的病理机制以及治疗策略的设计提供数据基础。数据集归入神经系统疾病/其他类别,主题标签为转录组学,来源于omicsdi.org。
【数据集背景】
C9ORF72基因中的六核苷酸重复扩增是肌萎缩侧索硬化与额颞叶痴呆最常见的遗传原因。针对C9-ALS/FTD的人体影像学研究和实验研究均提示,大脑在疾病早期就已发生改变,但这些改变的具体性质与发生机制仍缺乏充分认识。为界定这些早期变化,研究者采用源自C9-ALS/FTD患者与对照的脑类器官模型,在培养至第90天时构建单细胞RNA测序数据集。该数据集的出发点在于从单细胞分辨率观察疾病相关模型的早期状态,从而为理解疾病起病过程以及治疗策略的设计提供线索。
【数据内容】
该数据集的核心内容是第90天人类C9ORF72-ALS/FTD脑类器官的单细胞RNA测序数据,同时包含来自对照的相应数据,以便在单细胞水平上对患者来源与对照来源的类器官进行比较性刻画。数据以转录组学为主题,属于单细胞层面的基因表达测量。除上述单细胞RNA测序数据集的整体定位外,源站未提供关于样本数量、细胞数、测序深度、基因数目、细胞类型组成或具体分析结果等更细化的信息。
【采集与来源】
数据来源于omicsdi.org。其生物材料为源自C9-ALS/FTD患者及对照的脑类器官模型,取材时间点为体外培养的第90天。源站描述表明,该数据集是通过对上述类器官进行单细胞RNA测序而生成的。关于具体的样本采集流程、类器官培养方案、测序平台、建库方法及数据处理管线等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究与C9ORF72六核苷酸重复扩增相关的ALS/FTD早期病理变化,尤其是借助人源脑类器官模型在单细胞分辨率下考察疾病起始阶段细胞状态与基因表达特征的场景。由于数据同时涵盖患者来源与对照来源的类器官,可用于两类样本之间的对照性分析。此外,该数据集也可为理解疾病起病机制和设计治疗策略的相关研究提供基础数据支持。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供关于数据下载方式、文件格式、数据组织方式、预处理步骤、分析流程或使用协议的具体说明。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、批次效应、技术偏差、样本代表性或验证结果的具体信息。可以明确的是,该数据集基于体外脑类器官模型而非人体组织直接取样,其结论外推到人脑生理与病理状态时需谨慎;除此之外的具体限制,源站未提供。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE264012
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
C9ORF72基因中的六核苷酸重复扩增(HRE)是肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶痴呆(FTD)最常见的遗传原因。人类影像学和实验性研究提示C9-ALS/FTD患者大脑中存在早期变化,但这些变化仍知之甚少。为了明确这些变化,我们利用源自C9-ALS/FTD患者和对照组的脑类器官模型,在第90天创建了单细胞RNA测序数据集。这些数据集将有助于揭示对于理解疾病发作和设计治疗策略至关重要的初始病理变化。
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