脂质-siRNA偶联物在小鼠中枢神经系统中的细胞特异性基因沉默

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-13964

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们开发了一种脂质-siRNA偶联物，命名为EG18，其能在脑脊液注射后增强整个中枢神经系统中长期的基因沉默效果。为了辅助识别可行的治疗靶点，我们采用单细胞RNA测序(scRNAseq)来确定细胞特异性的基因沉默。在此，我们使用针对Ppib的siRNA测序，并向成年小鼠的侧脑室注射15纳摩尔的Ppib-EG18或非靶向对照(NTC)-EG18。1个月后，将大脑解离成单个细胞，并通过珠分选为Cd11b+和Cd11b-群体。Cd11b+数据集包含微胶质细胞和巨噬细胞，而Cd11b-样本则包含了其他分离出的血管周围和实质群体的抽样。scRNAseq揭示了在实质和脑边缘多种细胞群体中的基因沉默活性，这可能为疾病修饰疗法提供新的途径。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。